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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 【其他】在线答疑:VASP的问题
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

[交流] 【其他】在线答疑:VASP的问题 已有104人参与

vasp是一个很不错的软件，尤其称道的是他的计算速度和稳定性。
由于wuchenwf版主即将隐退，特开此贴。
本人能力也极其有限，所以在此抛砖引玉，标题虽是答疑，但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻，VASP的每个方面不可能都掌握。希望和大家也共同进步。

老帖地址（供大家参考）（wuchenwf）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1740019&fpage=1

老帖地址（供大家参考）（九尾鱼）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=679096&fpage=1

老帖地址（供大家参考）（wuchenwf）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1083523
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真理是一点点接近的！
1楼 2010-04-06 11:31:28
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haowenping

木虫 (著名写手)
还有由于帖子长度受限制了，所以没能把我出错的情况列下来，下面是我make后出现的错误：
我再make 一下出现下面的问题：
[root@localhost vaspmpi5.2]# make
./preprocess fftw3d.f90 -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC
mpif90 -FR -lowercase -assume byterecl  -O3  -c fftw3d.f90
./preprocess fft3dlib.f90 -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC
mpif90 -FR -lowercase -O2 -c fft3dlib.f90
make: Warning: File `/usr/local/fftw/lib/libfftw3.a' has modification time 1.4e+08 s in the future
./preprocess main.f90 -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC
mpif90 -FR -lowercase -assume byterecl -FR -O0   -c main.f90
rm -f vasp
mpif90 -o vasp main.o  base.o     mpi.o      smart_allocate.o      xml.o constant.o jacobi.o   main_mpi.o  scala.o asa.o      lattice.o  poscar.o   ini.o       xclib.o     xclib_grad.o radial.o   pseudo.o   mgrid.o    gridq.o     ebs.o mkpoints.o wave.o     wave_mpi.o  wave_high.o symmetry.o symlib.o   lattlib.o  random.o      nonl.o     nonlr.o    nonl_high.o dfast.o    choleski2.o mix.o      hamil.o    xcgrad.o   xcspin.o    potex1.o   potex2.o metagga.o constrmag.o cl_shift.o relativistic.o LDApU.o paw_base.o egrad.o    pawsym.o   pawfock.o  pawlhf.o    paw.o mkpoints_full.o       charge.o   dipol.o    pot.o dos.o      elf.o      tet.o      tetweight.o hamil_rot.o steep.o    chain.o    dyna.o     sphpro.o    us.o  core_rel.o aedens.o   wavpre.o   wavpre_noio.o broyden.o dynbr.o    rmm-diis.o reader.o   writer.o   tutor.o xml_writer.o brent.o    stufak.o   fileio.o   opergrid.o stepver.o chgloc.o   fast_aug.o fock.o     mkpoints_change.o sym_grad.o mymath.o   internals.o dimer_heyden.o dvvtrajectory.o vdwforcefield.o hamil_high.o nmr.o    force.o pead.o     subrot.o   subrot_scf.o pwlhf.o  gw_model.o optreal.o   davidson.o electron.o rot.o  electron_all.o shm.o    pardens.o  paircorrection.o optics.o   constr_cell_relax.o   stm.o    finite_diff.o elpol.o hamil_lr.o rmm-diis_lr.o  subrot_cluster.o subrot_lr.o lr_helper.o hamil_lrf.o   elinear_response.o ilinear_response.o linear_optics.o linear_response.o setlocalpp.o  wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o local_field.o ump2.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o    fftmpi.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o  /usr/local/fftw/lib/libfftw3.a -L../vasp.5.lib -ldmy  
mpi.o: In function `m_max_d_':
mpi.f90.text+0xef3): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sumb_d_':
mpi.f90.text+0x10b9): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sumb_s_':
mpi.f90.text+0x1279): undefined reference to `scopy_'
mpi.o: In function `m_sum_s_':
mpi.f90.text+0x151a): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sumb_z_':
mpi.f90.text+0x17c8): undefined reference to `zcopy_'
mpi.o: In function `m_alltoallv_z_':
mpi.f90.text+0x269e): undefined reference to `zcopy_'
mpi.o: In function `m_cycle_d_':
mpi.f90.text+0x2a0f): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sumf_d_.':
mpi.f90.text+0x3627): undefined reference to `daxpy_'
mpi.f90.text+0x36c8): undefined reference to `dcopy_'
mpi.f90.text+0x37e0): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_alltoall_d_.':
mpi.f90.text+0x3d5e): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sum_z_':
mpi.f90.text+0x4043): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sum_d_':
mpi.f90.text+0x4221): undefined reference to `dcopy_'
mpi.o: In function `m_sum_single_':
mpi.f90.text+0x4401): undefined reference to `scopy_'
....
希望你帮我看下到底是哪里出了问题。
我一开始的电脑上编译了vasp4.6，我可能没有把vasp4.6完全删掉，我是不知道到底出了什么问题，希望楼主不吝帮忙。谢谢！
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人有多大胆，地有多大产！
146楼2010-12-10 16:47:36
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lishufei

金虫 (正式写手)

vasp安装

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄把root 改成bin
怎么改？ 谢谢前辈啊
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2楼2010-04-13 21:12:08
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lishufei

金虫 (正式写手)
★ ★
xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-04-13 22:53
gavinliu7390:你的编译过程应该没问题。 2010-04-14 07:41
说明一下我安装的是串行的安装方法如下：
vasp4.6 安装全部过程
串行所需文件
l_fc_c_9.1.036.tar     l_mkl_p_9.1.023.tar    makefile 串行    NCOM_L_MKL__NP5T-TXVGVMK8.lic     vasp.4.6.tar.gz       vasp.4.lib.tar.gz
NCOM_L_CMP_FOR_NC5M-MNS7LCG3.lic
1. 解压l_mkl_p_9.1.023.tar
    命令 tar  -xvf  l_mkl_p_9.1.023.tar
     进入l_mkl_p_9.1.023   命令cd l_mkl_p_9.1.023
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
2  解压 l_fc_c_9.1.036.tar
    命令  tar  -xvf l_fc_c_9.1.036.tar
     进入l_fc_c_9.1.036 命令 cd  l_fc_c_9.1.036.tar
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
注意所有安装都在root下 进入安装说明里会有提示。
3   改变量环境
    退出后 进入根目录su 口令
     新目录要cd 再回车 显示~
     输入 vi .bashrc  回车
     进入后改成   
      # .bashrc

      # User specific aliases and functions

        alias rm='rm -i'
        alias cp='cp -i'
        alias mv='mv -i'
        PATH="$PATH:/usr/local/bin"  (该部分为mpich2的路径）注意安装并行才用
        # Source global definitions
         if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc

       fi   （以下为mkl及fortran安装后需设置的环境变量）
         export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/mkl/9.1.023/lib/em64t:/opt/intel/fce/9.1.036/lib
. /opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh
export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh:$LD_LIBRARY_PATH
注意进入后按i才能对内容修改。
改好后按esc键 ：wq 这是保存并退出。
保存后在终端执行命令source /root/.bashrc就可以了
执行没错即可。
4  进入放文件的目录 cd  
  解压vasp.4.6.tar.gz    和   vasp.4.lib.tar.gz
   tar xzvf vasp.4.6.tar.gz  和tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz
进入vasp.4.lib目录 cd vasp.4.lib
cp makefile.linux_ifc_P4  makefile
打开makefile文件修改FC=ifort 保存文件
make
编译成功后，得到libdmy.a文件。
5  退出vasp.4.lib目录 进入vasp.4.6目录
  把上面的makefile拷贝到vasp.4.6里去。（这里面是修改过的不需要改动）
进行make
运行结束安装成功。如果显示某行错误可在打开makefile文件找到那行，如果前面没有#就加上#，如果有#就去掉#。在进行make。
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3楼2010-04-13 21:14:24
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞
★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):谢谢解答 2010-04-15 08:38
引用回帖:
Originally posted by lishufei at 2010-04-13 21:12:08:
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄 ...

如果你的vasp已经编译成功，找不到命令。一般解决办法有三种。由于编译好后会生成一个vasp文件。
一，你可以将这个vasp文件考到~/bin目录下。然后在系统的任何位置都可以执行vasp.
二，如果上面的方法不可以，你就考到/usr/local/bin　目录下，不过这个需要超级用户密码。
三，例如你编译成功的目录是~/software/vasp/，你在任何位置执行的时候可以直接执行~/software/vasp/vasp，　也可以。
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真理是一点点接近的！
4楼2010-04-14 07:39:56
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