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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » NBO/AIM » 【求助】使用GENNBO5.0W计算出现内存不够的问题？怎么解决
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gaochao85

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】使用GENNBO5.0W计算出现内存不够的问题？怎么解决 已有2人参与

最后两行

*** Insufficient MEMORY to continue;
*** NRT needs additional    -7194189 bytes.
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1楼 2010-04-05 20:11:49
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gaochao85

铜虫 (正式写手)
再有两个问题，
1. 使用G03计算键级 应该用下面那个：
Wiberg bond index matrix in the NAO basis:  ？
Atom-atom overlap-weighted NAO bond order:   ？
MO bond order:       ？（有负值？）

2.    Atom    1       2       3   
   ---- ------  ------  ------
1. Al  0.0000  0.4063 -0.6729
2.  O  0.4063  0.0000 -0.0802
3.  O -0.6729 -0.0802  0.0000
那个是键级值，Al1-O2值是不是0.4063？
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2楼2010-04-05 20:16:55
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
gaochao85(金币+5):谢谢哈，我算的是个Al8的团簇模型，软件是网上下载的，自己不会编译。所以现在没办法了，打算用G03自带的NBO3.0来算，使用Wiberg下面的数据，不知道行不行 2010-04-06 14:46
如果确实内存不够，要么改NBO源代码，重新编译；要么换个内存足够大的计算机。关键看代码里是否定义了内存总量。不过，有时候是格式问题。（另：你的.47文件是如何产生的？）

NBO5有5种键级：除了你提到的三种以外（keyword=BNDIDX），还有NLMO（keyword=NLMO）和NBO键级（keyword=NRT；NBO 4.0以上版本）。常用的是Wiberg，NLMO，和NBO。NBO键级可以把键级分解成共价成分和离子成分，不过代码不稳定，很多体系会出错。对有些高对称体系，NLMO有时会破坏对称性。如果没有特别要求，一般用Wiberg就足够了。

如果你计算的是O-Al-O结构，键级结果是不合理的。估计是从头计算中用了低对称性，得到非物理的解。其中两个Al-O键不等价，一个O原子处于激发态。

[ Last edited by beefly on 2010-4-5 at 23:19 ]
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2010-04-05 23:16:44
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gaochao85

铜虫 (正式写手)
我算的是个Al8的团簇模型，软件是网上下载的，自己不会编译。所以现在没办法了，打算用G03自带的NBO3.0来算，使用Wiberg下面的数据，不知道行不行。

Wiberg bond index matrix in the NAO basis:  
下面的是不是对应值就是键级数值，不用在计算？
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-04-05 23:16:44:
如果确实内存不够，要么改NBO源代码，重新编译；要么换个内存足够大的计算机。关键看代码里是否定义了内存总量。不过，有时候是格式问题。（另：你的.47文件是如何产生的？）

NBO5有5种键级：除了你提到的三种 ...

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4楼2010-04-06 14:47:20
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★
yzcluster(金币+1):估计他算得是铝氧团簇。这个体系我印象当中具有芳香性。似乎吉林大学一个叫孙娇的做过这个体系。 2010-04-06 23:15
gaochao85(金币+5):我算的是个Al2O3的簇 2010-04-07 10:05
可以用Wiberg。不过，Al8怎么会出现O原子呢？
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2010-04-06 23:10:32
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