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gaochao85

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】使用GENNBO5.0W计算出现内存不够的问题?怎么解决 已有2人参与

最后两行

*** Insufficient MEMORY to continue;
*** NRT needs additional    -7194189 bytes.
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gaochao85

铜虫 (正式写手)

再有两个问题,
1. 使用G03计算键级 应该用下面那个:
Wiberg bond index matrix in the NAO basis:  ?
Atom-atom overlap-weighted NAO bond order:   ?
MO bond order:       ?(有负值?)

2.    Atom    1       2       3   
   ---- ------  ------  ------
1. Al  0.0000  0.4063 -0.6729
2.  O  0.4063  0.0000 -0.0802
3.  O -0.6729 -0.0802  0.0000
那个是键级值,Al1-O2值是不是0.4063?
2楼2010-04-05 20:16:55
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

gaochao85(金币+5):谢谢哈,我算的是个Al8的团簇模型,软件是网上下载的,自己不会编译。所以现在没办法了,打算用G03自带的NBO3.0来算,使用Wiberg下面的数据,不知道行不行 2010-04-06 14:46
如果确实内存不够,要么改NBO源代码,重新编译;要么换个内存足够大的计算机。关键看代码里是否定义了内存总量。不过,有时候是格式问题。(另:你的.47文件是如何产生的?)

NBO5有5种键级:除了你提到的三种以外(keyword=BNDIDX),还有NLMO(keyword=NLMO)和NBO键级(keyword=NRT;NBO 4.0以上版本)。常用的是Wiberg,NLMO,和NBO。NBO键级可以把键级分解成共价成分和离子成分,不过代码不稳定,很多体系会出错。对有些高对称体系,NLMO有时会破坏对称性。如果没有特别要求,一般用Wiberg就足够了。

如果你计算的是O-Al-O结构,键级结果是不合理的。估计是从头计算中用了低对称性,得到非物理的解。其中两个Al-O键不等价,一个O原子处于激发态。

[ Last edited by beefly on 2010-4-5 at 23:19 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2010-04-05 23:16:44
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gaochao85

铜虫 (正式写手)

我算的是个Al8的团簇模型,软件是网上下载的,自己不会编译。所以现在没办法了,打算用G03自带的NBO3.0来算,使用Wiberg下面的数据,不知道行不行。

Wiberg bond index matrix in the NAO basis:  
下面的是不是对应值就是键级数值,不用在计算?
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-04-05 23:16:44:
如果确实内存不够,要么改NBO源代码,重新编译;要么换个内存足够大的计算机。关键看代码里是否定义了内存总量。不过,有时候是格式问题。(另:你的.47文件是如何产生的?)

NBO5有5种键级:除了你提到的三种 ...

4楼2010-04-06 14:47:20
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家


yzcluster(金币+1):估计他算得是铝氧团簇。这个体系我印象当中具有芳香性。似乎吉林大学一个叫孙娇的做过这个体系。 2010-04-06 23:15
gaochao85(金币+5):我算的是个Al2O3的簇 2010-04-07 10:05
可以用Wiberg。不过,Al8怎么会出现O原子呢?
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2010-04-06 23:10:32
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