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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Abinit » 【求助】2个abinit计算问题
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casjxm

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】2个abinit计算问题已有4人参与

有两个问题想请教各位：
1. 各位在abinit计算中的ecut 一般设置多少，才能保证结果有一定的可靠度，比如在光学计算中。
2.  我的机器在计算中只要ecut设置高一点，就算不了了，出现错误p4_error: alloc_p4_msg: Message size exceeds P4s maximum message size: 305260800，且P4_GLOBMEMSIZE也改为很大，但不起作用，不知如何解决。49G内存，16核。
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1楼2010-04-05 16:16:32
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
gavinliu7390(金币+3):谢谢 2010-04-06 11:55
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-06 16:38
关于能量截断，你最好自己测试一下。光学计算怎么着也得几百个eV吧。
关于计算问题，估计和你用的编译器有关，你用的什么编译器？ ifort, pgi, 还是gfortran. 如果是gfortran,这个问题很常见。
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2楼2010-04-05 16:38:31
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casjxm

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-04-05 16:38:31:
关于能量截断，你最好自己测试一下。光学计算怎么着也得几百个eV吧。
关于计算问题，估计和你用的编译器有关，你用的什么编译器？ ifort, pgi, 还是gfortran. 如果是gfortran,这个问题很常见。

用的是gFortran，不知道该如何解决？望高手相助
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3楼2010-04-05 16:46:18
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
casjxm(金币+15): 2010-04-05 17:46
gavinliu7390(金币+3):谢谢！ 2010-04-06 11:56
hometownlove(金币+1):专家 2010-04-06 16:38
这个好像是gfortran的内核的问题，建议你改用ifort,网上有免费版下载。
此外，你的mpi在编译的时候也要设置这个参数，还是比较复杂的。
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4楼2010-04-05 16:50:19
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casjxm

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-04-05 16:50:19:
这个好像是gfortran的内核的问题，建议你改用ifort,网上有免费版下载。
此外，你的mpi在编译的时候也要设置这个参数，还是比较复杂的。

你是说用ifort编译abiniP？
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5楼2010-04-05 17:07:02
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★ ★
casjxm(金币+5): 2010-04-06 09:20
gavinliu7390(金币+2):谢谢专家！ 2010-04-06 11:56
是用ifort编译mpi或者openmpi.看你用的什么并行环境了。
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6楼2010-04-05 23:45:51
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lono75

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
casjxm(金币+5): 2010-04-06 09:20
gavinliu7390(金币+2):谢谢 2010-04-06 11:57
casjxm(金币+5): 2010-04-28 09:46
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-04-05 23:45:51:
是用ifort编译mpi或者openmpi.看你用的什么并行环境了。

用ifort11,mpich1.2/openmpi1.3编译并行不成功,
mpich2没试.
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由天命,成人事！
7楼2010-04-06 08:51:55
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★ ★ ★
casjxm(金币+5): 2010-04-06 09:20
gavinliu7390(金币+3):正解！ 2010-04-06 11:57
casjxm(金币+5): 2010-04-28 09:46
下载openmpi，./configure FC=ifort CC=icc CXX=icpc make makeinstall 改好环境变量，有两个。一个是bin目录，还有一个自己找下。然后在6.0.2里./configure FC=mpif90 F77=mpif77 CC=mpicc CXX=mpic++ --enable-mpi-io
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8楼2010-04-06 09:06:05
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casjxm

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2010-04-06 09:06:05:
下载openmpi，./configure FC=ifort CC=icc CXX=icpc make makeinstall 改好环境变量，有两个。一个是bin目录，还有一个自己找下。然后在6.0.2里./configure FC=mpif90 F77=mpif77 CC=mpicc CXX=mpic++ --enable- ...

请问装openmpi 时是不是也要改一下里面的关于message size 设置的信息
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9楼2010-04-06 11:14:01
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
casjxm(金币+5): 2010-04-06 21:52
casjxm(金币+15): 2010-04-28 09:46
引用回帖:
Originally posted by casjxm at 2010-04-06 11:14:01:



请问装openmpi 时是不是也要改一下里面的关于message size 设置的信息

是的，默认的参数是很小的，你编译configure的时候就可以改
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10楼2010-04-06 17:09:43
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