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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】RAPD-电泳图分析
汕头大学海洋科学接受调剂
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icetong

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】RAPD-电泳图分析 已有7人参与

请高人分析一下这个图什么意思



非常感谢~
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1楼 2010-04-04 13:11:53
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)
★
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你单单拿这个图怎么分析啊。。。你要标注每个泳道是什么，Mark用的是多少大的。。。
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看的开才是真本事~
2楼2010-04-04 13:56:13
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★ ★
amisking(金币+2): 2010-04-07 12:46
RAPD的结果就是条带多，清晰就好，上面的图好像没有泳道合格（如果条带多的那两个孔是Marker的话）
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3楼2010-04-04 16:42:52
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

有点乱

★ ★
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scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-04-07 12:33
楼主确实弄得有点乱啊，不要紧，不着急，慢慢来。你把改写的东西都写清楚，我看家上面的还没有Marker标定。拍照的时候大概没放好，上面还有一块黑暗的，适当的调节一下曝光率会好看些。再说清楚点吧。Marker跑的也不是很好，下次注意点时间长一些，把它跑开了。Marker最大和最小各是多少？
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4楼2010-04-04 17:47:33
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特洛伊

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+5):鼓励新虫！欢迎多来交流！:tiger06: 2010-04-07 12:33
其他的不说，没有把胶洗干净就照相。感观上就不好。
1.M选择DL2000就可以了，你那个M估计是50-100bp的吧。
2.上面的黑块，主要是胶没有放好，调整下位置就可以解决。
3.出现弥散是模板的问题，建议做筛选。
4.你2块胶一起做，就应该插一样的梳子，貌似梳子大小也不一样。
RAPD 重复性的问题，LZ一定要注意了。
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成本
5楼2010-04-06 09:41:50
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icetong

银虫 (小有名气)
不好意思啊，我第一次做RAPD，这两块最左边的是Marker，然后我做的是对照组和暴毒组的比较，从左到右两个是同一个引物的对照组和暴毒组，我想问一下，对于上面那块，条带没有分开的和好多条的是什么意思，感觉所有暴毒组都没有条带显示。对于下面那一块对照组和暴毒组有一样的条带是不是没有差别？
O(∩_∩)O谢谢！
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6楼2010-04-06 20:12:34
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icetong

银虫 (小有名气)
大家的建议很好，我会进一步完善的~谢谢！
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7楼2010-04-06 20:14:42
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zzw1221

木虫 (著名写手)
★ ★
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scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-04-07 12:33
标记之前一般先要摸索好一些基本的反应体系吧，然后再做。如模板浓度，退伙温度，各个试剂的加入量。再做，这个预试验是必要的。
至于你操作的问题，楼上各位分析的差不多了，呵呵，别急，加油
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8楼2010-04-06 21:34:03
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lyg7720349

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+5):鼓励新虫！欢迎多来交流！:tiger06: 2010-04-07 12:34
应该是你点样不小心导致DNA漏了吧
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望大家都各有所获！
9楼2010-04-06 21:53:49
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wangqk198738

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by icetong at 2010-04-06 20:12:34:
不好意思啊，我第一次做RAPD，这两块最左边的是Marker，然后我做的是对照组和暴毒组的比较，从左到右两个是同一个引物的对照组和暴毒组，我想问一下，对于上面那块，条带没有分开的和好多条的是什么意思，感觉所有 ...

还是说，照楼主的说法，得把引物拿出来，要是说在一条泳道里有条带，一般来说是Olig dT/A的原因，它们特异性差吗？再者就是说你设计的那个特异性引物特异性差了点，通常无非就这两个原因。还有就是PCR的时候机器有毛病，温度在一个阶段有大的变化，导致结合不稳。你想想这样不就乱了套了，条带多无可厚非。
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10楼2010-04-07 12:43:13
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