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zhangguangping

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】求助:dalton-2.0编译及测试问题【完结】 已有1人参与

我现在在集群上安装dalton-2.0,使用的是已经安装好了的ifort-10,mkl10.2,openmpi-1.2.6.这三个组件都能正常工作(编译出来的其他的程序能并行计算)!但是现在编译dalton-2.0的时候编译倒是通过了,但是就是不能算东西!连测试也通不过!
我的系统是suse,机器是intel的!
我的配置文件是:
--------------------------
ARCH          = linux
FMMDIR        = mm
#
CPPFLAGS      = -DVAR_LINSCA -DVAR_IFC -DMOD_FMM -DGFORTRAN=412 -DSYS_LINUX -DVAR_MFDS -D'INSTALL_WRKMEM=20000000' -D'INSTALL_BASDIR="/home/zhanggp/software/dalton-2.0/basis/"' -DVAR_MPI -DIMPLICIT_NONE -DSMALL_STATIC_ALLOCATION
F77           = mpif90
F90           = mpif90
FLNK          = mpif90
CC            = mpicc
RM            = rm -f
FFLAGS        = -O3 -w -g
F90OPTFLAGS   = -O3 -w -fpp -g
SAFEFFLAGS    = -O2 -w -g
CFLAGS        = -O3 -std=c99 -DRESTRICT=restrict -DFUNDERSCORE=1
INCLUDES      = -I../include
LIBS          = -L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_lapack -lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide -lpthread
INSTALLDIR    = /home/zhanggp/software/dalton-2.0/bin
PDPACK_EXTRAS = linpack.o eispack.o gp_dlapack.o gp_zlapack.o
GP_EXTRAS     =
AR            = ar
ARFLAGS       =  rvs
#
default : linuxparallel.x
#
# Parallel initialization
#
MPI_INCLUDE_DIR =
MPI_LIB_PATH    =
MPI_LIB         =
#
#
# Suffix rules C
#
.SUFFIXES : .f90 .F .o .c

.f90.o:
        $(F90) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(F90OPTFLAGS) -c $*.f90

.F.o:
        $(F77) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(FFLAGS) -c $*.F

.c.o:
        $(CC) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) -c $*.c

#ajt Remove debian linux built-in rule
%.o: %.mod
------------------------
测试出的问题是(剪切的其中一个测试的错误):
---------------------------
###########################################################
start now with test cc_rsp_twophotdirect:
-----------------------------------------------------------
   cc_rsp_twophotdirect
   --------------------
   Molecule:         HF in C2v
   Wave Functions:   CCS, CC2, CCSD / 6-31G**
   Test Purpose:     Integral-direct calculation of twophoton
                     transition moments
info: dummy MPI_INIT called, nothing done
info: dummy MPI_FINALIZE called, exiting ...

  --- SEVERE ERROR, PROGRAM WILL BE ABORTED ---
dummy MPI_FINALIZE called, exiting ...
100
   Dalton Release 2.0 (Feb. 2005)
   Invocation: /home/zhanggp/software/dalton-2.0/test/../bin/dalton -ext log cc_rsp_twophotdirect cc_rsp_twophotdirect
   Sat Apr  3 21:15:49 CST 2010
   Calculation: cc_rsp_twophotdirect  (input files: cc_rsp_twophotdirect.dal and cc_rsp_twophotdirect.mol)
   Input dir  : /home/zhanggp/software/dalton-2.0/test/2010-04-03T21_03-testjob
   Scratch dir: /tmp//zhanggp/cc_rsp_twophotdirect
  --- SEVERE ERROR, PROGRAM WILL BE ABORTED ---
     Date and time (Linux)  : Sat Apr  3 21:16:29 2010
     Host name              : cl232                                   
Reason: dummy MPI_FINALIZE called, exiting ...
>>>> Total CPU  time used in DALTON:  36.06 seconds
>>>> Total wall time used in DALTON:  40.00 seconds
Error in /home/zhanggp/software/dalton-2.0/bin/dalton.x, exit code 100
cc_rsp_twophotdirect.tar.gz has been copied to /home/zhanggp/software/dalton-2.0/test/2010-04-03T21_03-testjob
- THEREFORE scratch directory /tmp//zhanggp/cc_rsp_twophotdirect is not deleted
  by this script so you may restart the calculation, if possible
  ( /tmp//zhanggp/cc_rsp_twophotdirect may be deleted by your queueing system )
- REMEMBER to delete /tmp//zhanggp/cc_rsp_twophotdirect yourself !!!

evaluate output file ./cc_rsp_twophotdirect.log:
-----------------------------------------------------------
TEST FAILED ABNORMALLY
###########################################################

-----------------------------
两外我想所有的数学库函数都想用MKL的, linpack.o eispack.o gp_dlapack.o gp_zlapack.o这四个都不想采用!该怎么弄啊?
虫子高手帮帮忙吧!
在线等待!

[ Last edited by zhangguangping on 2010-5-9 at 06:55 ]
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天空空

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个 应该发到量化版吧?
好好学习,天天向上!嘿嘿
2楼2010-04-03 23:43:04
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