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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请教个OPT的问题~~ 已有3人参与

请教大家几个OPT的问题:
1. OPT+FREQ的时候,OPT完了是4个YES,FREQ得到的振动频率和上面给的那3个振动频率几乎一样,但是最后程序补充算的那步OPT(就是频率算完之后),前两个是YES,后两个是NO。这个情况还需要再继续优化吗?
2.优化1个复合物,总是有一个10几的虚频,用过各种方法(tight,加虚频振动坐标,nosymm,换直角坐标)都去不掉。文献中说过这种复合物的势能面非常平,跟反应中间体几乎一样,也有文献处理类似体系的时候有虚频,也没去管他,就说了句“只是研究最小,不是研究势能面”。这种情况需不需要一定让虚频消失呢?
谢谢!

[ Last edited by qzhaosdu on 2010-4-2 at 17:22 ]
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

自己顶,不要沉
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
2楼2010-04-02 21:24:18
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fooo

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
aylayl08(金币+3):谢谢讨论交流 2010-04-03 08:34
qzhaosdu(金币+3):谢谢 2010-04-03 10:24
1. 不需要再继续优化了。
2.不需要一定让虚频消失,但要看你的体系。如果是一个小分子,有虚频恐怕是难以接受的。如果是一个很大的分子(比如多肽),或许可以容忍数值很小的虚频。这是个人观点,仅供参考。
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-04-02 17:16:24:
请教大家几个OPT的问题:
1. OPT+FREQ的时候,OPT完了是4个YES,FREQ得到的振动频率和上面给的那3个振动频率几乎一样,但是最后程序补充算的那步OPT(就是频率算完之后),前两个是YES,后两个是NO。这个情况还需 ...

3楼2010-04-03 03:07:51
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+4):谢谢讨论交流 2010-04-03 08:34
qzhaosdu(金币+3):谢谢 2010-04-03 10:25
算过频率之后高斯会顺便用已经准确计算的二阶导数信息做一次“优化测试”来检验当前结构是否收敛足够充分。opt的过程中除非calcall,否则每步会使用靠一阶导数不断校正来得到近似Hessian矩阵,但在这不够精确的Hessian矩阵下被判为收敛的结构到了freq任务通过精确的Hessian矩阵重新检验时,若有NO,说明当前稳定结构并不够准确,一般建议由chk文件读取Hessian矩阵继续优化,除非认为可以接受粗糙的结果。
4楼2010-04-03 04:41:10
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5楼2010-04-07 16:17:41
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by yling10 at 2010-04-07 16:17:41:

拒绝灌水~~~~
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
6楼2010-04-07 16:36:02
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wzh上善若水

木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
小团簇可以通过改一下输入坐标消除虚频
知 止 而 后 有 定 ; 定 而 后 能 靜 ; 靜 而 后 能 安 ; 安 而 后 能 慮 ; 慮 而 后 能 得
7楼2010-04-10 11:50:32
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