应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Dmol3计算问题！
101/1返回列表
查看: 1366  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

QQQ9589

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Dmol3计算问题！ 已有2人参与

大家好，请教个关于demol3几何优化的问题，下面的图片是我几何优化出来的能量收敛图，从这个图上看好像不收敛的，但是输出的.outdemol文件中显示的是Message: DMol3 job finished successfully
中间也没有信息提示说是不收敛。这个是怎么回事啊，到底收敛没呢？
请高手指点，多谢啦！




[ Last edited by aylayl08 on 2010-4-5 at 20:51 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-04-01 12:01:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+2):谢谢！ 2010-04-01 14:51
你的数据是一次优化的结果，还是110次优化的能量的比较？
如果是一次的能量的结果应该没什么意义，因为只要看最后的能量就可以了。如果是110次优化的结果就比较诡异了。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-04-01 12:23:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QQQ9589

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2010-04-01 12:23:10:
你的数据是一次优化的结果，还是110次优化的能量的比较？
如果是一次的能量的结果应该没什么意义，因为只要看最后的能量就可以了。如果是110次优化的结果就比较诡异了。

你说的一次优化和110优化的能量是什么意思啊？这个就是优化了110步达到我所要求的收敛精度啊，一般都是慢慢下降的直到稳定的，但是这个图形是一直在波动啊，不知道怎么回事？
赞一下 回复此楼
3楼2010-04-01 13:11:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QQQ9589

银虫 (小有名气)
我优化的时候用coarse比用fine结果还好，不知道怎么回事，理论上讲应该是Fine比较好的吧，如果coarse结果好，能用优化出来的结构计算其他的性质吗？谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2010-04-01 15:39:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
qli0218(金币+1):谢谢 2010-04-01 21:06
只要是提示说 DMol3 job finished successfully应该就可以了吧，中间过程没必要关心吧，毕竟我们需要的是最后的构型，以及和其他构型相比较的能量（也就是最后收敛之后的那个能量值）
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-04-01 19:59:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xianggui7895

银虫 (小有名气)
这不太像是收敛了吧？是不是已经到达最大优化步数了
赞一下 回复此楼
6楼2010-04-01 22:19:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsl_321123

铁虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
qli0218(金币+1):谢谢，鼓励新虫。 2010-04-02 08:41
优化的时候，一定要选上频率的计算，有可能你没有算频率。结果很快收敛完成了。实际上，相当于没优化。还有可能就是你计算频率了，如果计算频率了的话，你可以在outmol文件里面看看是否与虚频。一般情况下，只要你计算的输出文件里有频率计算，既是有虚频，也说明你的计算已经收敛。
赞一下(2人) 回复此楼
宁愿骑着自行车笑，不愿坐着宝马哭。。。。。
7楼2010-04-01 22:25:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiangwxr

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+2):谢谢！ 2010-04-03 18:38
你的体系含有金属原子吧，你设置Smearing了吗？我也碰到过类似问题，这种情况我认为计算有问题，所得分子结构不可靠，你可以看一下结果，应该某些键角和键长不合理。
用Coarse有可能会得到比Fine更“好”的结果，但应该在此基础上再用Fine优化一次。优化计算的初始结构很重要。
赞一下(3人) 回复此楼
8楼2010-04-02 09:23:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QQQ9589

银虫 (小有名气)
我在计算的时候就出现如一楼这样的图，一直在震动的，貌似不是在收敛的啊，但是结果竟然没提示什么错误，然后用优化出来的结构算频率的时候有几个虚频，是不是不对啊，虚频是怎么回事啊？？？多谢啦

[ Last edited by QQQ9589 on 2010-4-5 at 19:42 ]
赞一下 回复此楼
9楼2010-04-05 19:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ym23

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 12:08
凭经验说，你这种锯齿型优化曲线和能量曲线的结构就是，最终的结构肯定畸变非常大！
在优化的过程中，肯定出现过结构突变的情况，因此结果已经不可信了。
是否收敛也没有意义了。
你最好把Smearing设置到6-8之间试试。
赞一下(2人) 回复此楼
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
10楼2010-04-20 10:15:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 QQQ9589 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 01:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 00:52 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 什么时候开奖？ +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭