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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】【求助】vasp计算C-H键裂解问题
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intro987

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】vasp计算C-H键裂解问题

最近在计算甲烷分解，查文献一般正常的过渡态C-H解离键长都在1.5~1.8范围，我在Ag表面计算得到的键长却2.3.....做虚频居然也有，不过比较小，600多，有没有人也得到过类似结果啊，键长特别长，但还是有虚频的情况
计算参数也换过了，原来是用IBRION=1 NFREE=2做过渡态，看vasp说明书改为IBRION=3 SMASS=2试过，结果是一样的
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1楼 2010-03-27 10:20:55
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
关注. 有机物原子比较多,在固体表面上的模拟不是很困难?
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2楼2010-03-27 10:59:47
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lfhuang

木虫 (著名写手)
为什么过渡态没有虚频？
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先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
3楼2010-03-27 14:14:02
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intro987

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-03-27 10:59:47:
关注. 有机物原子比较多,在固体表面上的模拟不是很困难?

只做的甲烷，原子少，做起来还行
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4楼2010-03-27 15:26:03
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
过渡态的虚频是正常的吧
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5楼2010-03-27 17:07:22
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alick1102

铜虫 (小有名气)
★
qli0218(金币+1):谢谢 2010-03-28 12:54
intro987(金币+5):谢谢·！ 2010-03-29 08:26
引用回帖:
Originally posted by intro987 at 2010-03-27 10:20:55:
最近在计算甲烷分解，查文献一般正常的过渡态C-H解离键长都在1.5~1.8范围，我在Ag表面计算得到的键长却2.3.....做虚频居然也有，不过比较小，600多，有没有人也得到过类似结果啊，键长特别长，但还是有虚频的情况 ...

这样的结果应该是不对的。如果C-H为2.3的话，表明你没有优化到真正的过渡态。你可以看看虚频的振动方向，看看是不是C-H解离的方向。并不是有虚频就表示你做对了过渡态的。
另外，你是用NEB作的吗？
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到了博士的时候才知道，科学也不过是为了吃饭的。
6楼2010-03-27 23:47:55
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intro987

铁杆木虫 (小有名气)
xiaohunhun:谢谢回帖 2010-03-30 09:24
如何看虚频的振动方向呢？
是用NEB做的，做了cuagau三个表面的，其他两个表面做出来的过渡态键长，构型都看着合理，只是ag的看起来不正常，反应物产物的构型也进行过调整，结果基本一样，所以才做了虚频看看
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7楼2010-03-29 08:25:48
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
intro987(金币+2):谢谢 2010-03-30 10:04
我觉得有可能是对的，C-H键的键长在不同金属上变化会比较明显，600多的虚频也比较像C-H 断键的虚频
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8楼2010-03-29 11:31:43
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alick1102

铜虫 (小有名气)
★
xiaohunhun(金币+1):谢谢回帖 2010-03-30 09:24
intro987(金币+3):谢谢 2010-03-30 10:05
引用回帖:
Originally posted by intro987 at 2010-03-29 08:25:48:
如何看虚频的振动方向呢？
是用NEB做的，做了cuagau三个表面的，其他两个表面做出来的过渡态键长，构型都看着合理，只是ag的看起来不正常，反应物产物的构型也进行过调整，结果基本一样，所以才做了虚频看看

C-H 键键长过渡态应该在1.5-2.0之间会比较合理。
至于看虚频，你可以用一些软件来看。比如把格式转化陈Gaussview能读的。
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到了博士的时候才知道，科学也不过是为了吃饭的。
9楼2010-03-29 22:48:13
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intro987

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2010-03-29 11:31:43:
我觉得有可能是对的，C-H键的键长在不同金属上变化会比较明显，600多的虚频也比较像C-H 断键的虚频

嗯，键长我做过不少了，范围基本在1.4~1.8，这个就是偏离太大了，呵呵，觉得不大对
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10楼2010-03-30 10:04:23
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