24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 845  |  回复: 8
当前主题已经存档。

hexx621

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】过渡态搜索(怎么放初态和终态等)

本人做DFT计算,但对过渡态的搜索还是不太懂,开始怎么放置初态和终态,已经过渡态怎么才能更好更快的找到(dimmer,NEB等),谁有这方面的资料,能发给我一份吗,真的很感激。hexx621@163.com
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

玫瑰蜜

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-26 13:20
初态和终态不是随便放的,需要分别进行优化,找出能量相对最稳定的构型,然后搜索过渡态,有时候能量最稳定的构型也不是一定就可以搜到过渡态,就需要用次稳定的构型继续搜索。
2楼2010-03-26 12:10:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hexx621

银虫 (小有名气)

你好,那你有这方面的指导资料吗,我是初学者,那些最基本的我想搞懂。
3楼2010-03-28 17:01:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主


lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-28 21:13
我好像记得MS在Dmol3模块的入门指南里就有搜索过渡态的例子,你可以去看看
4楼2010-03-28 17:03:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hexx621

银虫 (小有名气)

MS 里面的搜索过渡态的方法跟我的不一样,我用的DFT计算,谢谢啊
5楼2010-03-28 17:20:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-28 21:14
引用回帖:
Originally posted by hexx621 at 2010-03-28 17:20:43:
MS 里面的搜索过渡态的方法跟我的不一样,我用的DFT计算,谢谢啊

Dmol3模块用的就是DFT方法啊
6楼2010-03-28 17:22:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3):呵呵,lei版主出马了 2010-03-29 08:19
我们的区刊RCS上就有专门讨论过渡态的 很详细
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1855761&fpage=1

做过渡态计算应该考虑的三件事
yjcmwgk
Research of Calculation and Simulation, 2010, Vol. 1, No. 1, Page 60.


过渡态、反应路径的计算方法及相关问题
sobereva
Research of Calculation and Simulation, 2010, Vol. 1, No. 1, Page 62-77.
7楼2010-03-28 21:16:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hexx621

银虫 (小有名气)

恩,谢谢你啊,这对我很有用
8楼2010-03-29 21:20:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjping

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
Thank you~ I have gotten it.
9楼2010-03-29 23:26:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hexx621 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见