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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Dmol可能进行有限温度下的 分子动力学模拟？
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)

[交流] 【求助】Dmol可能进行有限温度下的 分子动力学模拟？

dmol算了一个团簇体系，想看看它在有限温度下的稳定性怎么样，分子动力学可行不？
另外，对于团簇体系，是用NVE合适还是NVT合适呢？
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1楼 2010-03-24 08:59:16
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by yzcluster at 2010-03-24 10:12:51:
实不相瞒DMOL和CASTEP中的第一原子分子动力学程序都是鸡肋（例如无法进行模拟退火，而且DMOL的控温似乎有点问题。所以用这两个程序中的ab initio molecular dynamics发表的文章比较少）。如果真想做一些AIMD方面的 ...

因为基态结构是用dmol算的，只是想大致的能反映一定温度下的稳定性就可以了。编辑只给了几个星期的修改时间，现在算学CPMD也来不及。另外对团簇体系，用NVT合适还NVE好？
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3楼2010-03-24 10:46:36
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人
★ ★ ★
aaq2800(金币+2):谢谢先 2010-03-24 10:43
ice_rain(金币+3):谢谢 2010-03-24 22:00
实不相瞒DMOL和CASTEP中的第一原子分子动力学程序都是鸡肋（例如无法进行模拟退火，而且DMOL的控温似乎有点问题。所以用这两个程序中的ab initio molecular dynamics发表的文章比较少）。如果真想做一些AIMD方面的东西，可以用CPMD，当中包含了常用的AIMD方面，比如CP，BO等。
关于用AIMD计算体系，向你推荐两篇文献
PRB 61 2000 2329 以及其中的参考文献4

[ Last edited by yzcluster on 2010-3-24 at 10:15 ]
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2楼2010-03-24 10:12:51
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人
★ ★ ★ ★
gavinliu7390(金币+2):谢谢！ 2010-03-24 11:48
aaq2800(金币+2):谢谢 2010-03-24 14:45
ice_rain(金币+2):谢谢回帖指导 2010-03-24 22:00
引用回帖:
Originally posted by aaq2800 at 2010-03-24 10:46:36:

因为基态结构是用dmol算的，只是想大致的能反映一定温度下的稳定性就可以了。编辑只给了几个星期的修改时间，现在算学CPMD也来不及。另外对团簇体系，用NVT合适还NVE好？

没用过DMOL的分子动力学计算过。不过我觉得应该用NVT比较好，也就是基本保持系综的温度恒定（当然会有震荡）。而NVE就是微正则系综，保持粒子数，体积，和能量都不变的系综。另外，要注意选好时间步长。最后，在恒温时使用哪种热浴恐怕你要查一查。
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4楼2010-03-24 11:06:10
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