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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】菌株的鉴定
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【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 hyw0794 的 14 个金币

hyw0794

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】菌株的鉴定

我用用ITS引物做出测序结果，序列在如下：AGGACTCGAGTGATGGCTCCGGGTCCGACCTCCAACCCTTCTGTTATCTGACCTCTGTTGCCTCGGGGGCGACCCGGCCCTCGCGCCGGGGCCCCCCGTGGACCACCCTTTGAAACTCTTGCATCTTTGCGTCTGAGTATGATTTTGAATCAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTAACACCACTCAAGCCTCGTCTTGGTATTGGGCGCCCGCGGGGTCACACCCGCGCGCCTCAACGTCTCCGGCCGAGCCGTCCGTCTCTAAGCGTTGTGGAAACAGTTTCGCTTGCGAGCGCGGGCCGGTTCGTCAGCCGACCGAAGCCTTTTCTATTCCAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGGCGGAGGAA。请各位帮我比对一下，到底是？属？种，必有重谢！
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1楼 2010-03-23 13:33:54
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hyw0794

木虫 (正式写手)
因为我已经比对过，可是很难判断，我是第一次做鉴定，到底根据什么，谢谢！
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2楼2010-03-23 13:36:13
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j2

木虫 (正式写手)
hyw0794(金币+1): 2010-03-24 20:35
Penidiella rigidophora strain？
期待答案~~~~
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修炼ｉｎｇ，当虫仙……
3楼2010-03-23 15:36:45
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eileenjn

银虫 (小有名气)
hyw0794(金币+2): 2010-03-24 20:36
Penidiella rigidophora strain
相似度87%
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4楼2010-03-24 10:33:37
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muchongchong838

禁虫 (正式写手)
hyw0794(金币+1): 2010-03-24 20:36
本帖内容被屏蔽
5楼2010-03-24 12:23:45
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hyw0794

木虫 (正式写手)
我的菌种是真菌。
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6楼2010-03-24 14:01:38
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陈思容

铜虫 (正式写手)
hyw0794(金币+1): 2010-03-24 20:37
先上NCBI上blast,后面用clutal 和phylip做进化树，做分子鉴定，最好配合形态学鉴定
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7楼2010-03-24 14:35:13
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wulei0708

银虫 (小有名气)
hyw0794(金币+1): 2010-04-04 10:25
是Penidiella rigidophora，同源性达到99%。
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8楼2010-03-25 01:20:14
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bigvigor

做16s，作吧
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9楼2010-03-29 10:14:06
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jukongka

铁杆木虫 (著名写手)

年度最忠心木虫
是真菌的化先做18s咯
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10楼2010-04-01 12:56:35
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