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bs340248

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】cvff力场中没有所需原子类型如何使用msi2lmp转换成lammps的data文件?? 已有1人参与

大家好,新接触分子模拟,在使用lammps的时候发现被构建模型难住了,看见里面的msi2lmp工具,也找了一些前人的帖子,还是不能搞定,在这里请求大家的帮助,先谢谢大家。
我想重复一篇文献(J. Phys. Chem. C 2008, 112, 5795-5802),也问作者如何在data文件里面输入键角信息的,回复说使用msi2lmp这个工具,(回信:For the organic linker I used Forcite to automatically assign CVFF atom types. I assigned Zn and O atom types (and charges) manually. Once I convert the car/mdf files to a LAMMPS data file, I edit the data file so that I have the exact parameters.)
这里我就不清楚在手动分配Zn和O的原子类型(和电荷数)的时候是如何操作的,MS我也首次接触,希望大家帮下我。
谢谢
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susie8642

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-31 14:29
car/mdf是insight II的输出格式,可能作者使用这个软件先建立了模型,然后用msi2lmp转换成read-date格式。详细见我的问题贴。
2楼2010-03-31 11:05:42
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bs340248

铜虫 (小有名气)

谢谢,我看看哦
3楼2010-04-06 16:44:32
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