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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】问一个高斯09fchk文件转化的问题
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NUPT

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】问一个高斯09fchk文件转化的问题

我的计算是在linux系统下进行的，现在计算结构出来了 想把chk文件转化成fchk文件
出现错误如下：
formchk C2.chk
Read checkpoint file C2.chk
Write formatted file C2.fchk
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       44100 IPos=           0 Q=         11608160


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    36 SizExt =     32768 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =     1509888 FType=2 FMxFil=10000

Number           0          0          0          0          0        501        502        503
Base        926952     926913    1063452      41518    1509696     398362     399362    1015886
End        1015361     926915    1421285     221542    1509888     399362     404097    1016139
End1       1015361     926915    1421285     221542    1509888     399362     404097    1016139
Wr Pntr     926952     926913    1063452      41518    1509696     398362     399362    1015886
Rd Pntr     926952     926913    1063452      41518    1509696     398362     399362    1015886
Length       88409          2     357833     180024        192       1000       4735        253

Number         508        511        520        521        522        524        526        536
Base         40448     406865     465433     568841      40678     568876     745276     221542
End          40478     434597     465443     568876      41518     745276     921676     309952
End1         40478     434597     465443     568876      41518     745276     921676     309952
Wr Pntr      40448     406865     465433     568841      40678     568876     745276     221542
Rd Pntr      40448     406865     465433     568841      40678     568876     745276     221542
Length          30      27732         10         35        840     176400     176400      88410

Number         538        551        552        562        575        584        603        605
Base        309952     465467     465443     458989     465505     436707    1421285     926915
End         398362     465505     465467     465433     568841     436923    1509696     926952
End1        398362     465505     465467     465433     568841     436923    1509696     926952
Wr Pntr     309952     465467     465443     458989     465505     436707    1421285     926915
Rd Pntr     309952     465467     465443     458989     465505     436707    1421285     926915
Length       88410         38         24       6444     103336        216      88411         37

Number         619        665        670        672        674        695        698        701
Base        921676     434597     404097    1015361    1015530     436923    1016139    1016355
End         926913     436707     406865    1015530    1015886     438067    1016355    1063452
End1        926913     436707     406865    1015530    1015886     438067    1016355    1063452
Wr Pntr     921676     434597     404097    1015361    1015530     436923    1016139    1016355
Rd Pntr     921676     434597     404097    1015361    1015530     436923    1016139    1016355
Length        5237       2110       2768        169        356       1144        216      47097

Number         989        993        997        998
Base        438067     458067     458267      40478
End         458067     458267     458989      40678
End1        458067     458267     458989      40678
Wr Pntr     438067     458067     458267      40478
Rd Pntr     438067     458067     458267      40578
Length       20000        200        722        200
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
已放弃




而我把以前的高斯03的chk文件用formchk转化却又可以转化

请问这是怎么回事？  我应该如何转化才能使windows下的GV能够阅读计算结构呢？
十分感谢
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1楼 2010-03-18 18:19:20
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
NUPT(金币+2):谢谢，我又问了个问题O(∩_∩)O~ 2010-03-18 18:43
你是不是系统装了2个gaussian啊。
运行which formchk，看看它用的是03的formchk还是09的，如果错了，那就到09的目录下，运行./formchk C2.chk
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-03-18 18:30:11
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NUPT

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-03-18 18:30:11:
你是不是系统装了2个gaussian啊。
运行which formchk，看看它用的是03的formchk还是09的，如果错了，那就到09的目录下，运行./formchk C2.chk

我试了一下，它运行的是03的formchk
然后我又把chk文件拷到g09下去运行formchk  但是它还是错了，这个怎么才能改formchk的运行路径呢？  就像gaussian 03和09的那个路径 我想要那个formchk就要哪个formchk
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3楼2010-03-18 18:42:47
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★
NUPT(金币+3):十分感谢！！ 2010-03-18 19:24
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-18 20:34
我不是说了么，你cd /home/**/g09
然后运行./formchk yourfile.chk
你没有打前面的./吧
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-03-18 19:20:25
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
难道非要转化了才能看？ 我一直不知道阿？

我都看了这么旧了 惭愧
赞一下 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
5楼2010-03-18 19:23:36
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是否一定要转化，取决于你运行的系统。
赞一下(1人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
6楼2010-03-18 19:38:22
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