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linxia2009

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】PCR引物GC含量

PCR引物设计的时候有个原则是GC含量40%~60%,那么引物中GC含量达到72%,对PCR有什么影响?哪位虫虫可以说一下~~~谢谢!
我设计引物的时候遇到了这种情况,一条引物72%,一条70%的GC含量,这样的引物还能不能用啊?




谢谢各位虫子了~~~

[ Last edited by linxia2009 on 2010-3-18 at 12:26 ]
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
克隆级,无所谓,反正有带就好,切了就是
鉴定级,比如RT或者qPCR,不推荐……
2楼2010-03-17 22:33:52
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
退火温度可能很高,应该还是没有问题。
我曾经做过80%左右的,退火温度可能高于65°
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
3楼2010-03-17 22:34:05
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linxia2009

金虫 (正式写手)

PCR产物是准备做克隆的,主要是怕PCR效果不好,扩不出来~
4楼2010-03-17 22:39:21
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不会的,除非形成很严重的hairpin或者dimer,指自由能超过-10甚至-12的
5楼2010-03-17 22:54:46
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linxia2009

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-03-17 22:54:46:
不会的,除非形成很严重的hairpin或者dimer,指自由能超过-10甚至-12的

谢谢了啊~
6楼2010-03-17 22:59:01
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spiderboy

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这还算常见的了。。。我用过很多的,还更高,你可以提高点退火温度便可,镁离子也可以多加些
7楼2010-03-17 23:38:51
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yangjunzju

木虫 (正式写手)

提高退火温度
8楼2010-03-20 00:07:38
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