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liujodan木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】输入命令和过渡态求助
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问题1： 师兄了几个命令不知道什么意思，大家帮帮我: opt=(noeigentest nrscale internal) 。 问题2： 对分子筛环进行过渡态计算的时候，输入模型对其骨架结构已经进行了固定，但是在TS优化的时候，发现固定的原子有所移动，得到的模型已经不具备基本环状的基本骨架。请问问题出在什么地方？ 多谢各位的帮助啊！！ |
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4楼2010-03-18 20:12:15
liujodan
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
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- 虫号: 809913
- 注册: 2009-07-16
- 性别: GG
- 专业: 无机非金属基复合材料
没有人知道吗？？？ 
2楼2010-03-18 12:03:50
yjcmwgk
禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
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- 专业: 理论和计算化学
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liujodan(金币+5):谢谢 感动死了 2010-03-18 20:36
erylingjet(金币+8):厉害 2010-04-01 17:44
liujodan(金币+5):谢谢 感动死了 2010-03-18 20:36
erylingjet(金币+8):厉害 2010-04-01 17:44
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问题1： 师兄了几个命令不知道什么意思，大家帮帮我: opt=(noeigentest nrscale internal) 。 noeigentest 这个选项是不进行力场数有且只有一个负值的判定，这样计算时不容易出现错误。不过，这种方法比较危险。只有在进行粗略计算的时候才推荐使用它。如果正常进行计算，还是使用eigentest对势能面曲率进行测试比较好，其实eigentest才是默认选项。 nrscale 如果在牛顿法迭代过程中，step超过了信任半径DXMaxT，则调整为信任半径。所谓的信任半径是牛顿迭代法在工作中所使用的最大步长。如果高斯程序对密度矩阵的值的改变超过了DXMaxT，那么这个改变值将不被采信。要注意，这里采用的是经过Fletcher改进的新的信任半径，而不是原始的信任半径。 其实这个参数在这里毫无意义，因为这本来就是默认选项，写不写都一样。你可以问问你的师兄为什么要写这个选项，难道另有深意？恕我鲁钝。 internal 跟踪内坐标反应路径。这个选项我没用过。不过貌似这个选项很少用的。我倒是见过一个人说用opt能做出来，但是opt=internal就scf无法收敛了。没研究过这个选项。问问你的师兄吧，我们很期待你的师兄的指教呢。 问题2： 对分子筛环进行过渡态计算的时候，输入模型对其骨架结构已经进行了固定，但是在TS优化的时候，发现固定的原子有所移动，得到的模型已经不具备基本环状的基本骨架。请问问题出在什么地方？ 这个问题没法回答，除非给出你的输入文件。否则我也不知道问题处在什么地方啊 [ Last edited by yjcmwgk on 2010-3-18 at 20:27 ] |
5楼2010-03-18 20:25:25
