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souledge

专家顾问 (著名写手)

[交流] 【求助】[初级问题]如何建立锶铁氧体的结构?

刚刚开始接触Materials Studio,由于实验室没有人玩过这个,只好自己摸索道路。看到李明宪的讲义,突然联想到自己之前做过锶铁氧体的实验,于是想根据书上的步骤,照葫芦画瓢的来一个~结果,发现问题多多……
第一个问题是,当查到Sr Fe(12) O(19)时(194#空间群,a=5.9936, c=23.0376),看到原子位置分别为:
Atom  #   OX   SITE      x               y               z           SOF       H
Sr      1   +2    2 d    0.6667     0.3333       0.25           1.         0   
Fe      1   +3    2 a       0               0               0             1.         0   
Fe      2   +3    4 e       0               0          0.2549(2)    0.5       0   
Fe      3   +3    4 f     0.3333     0.6667    0.02718(2)    1.        0   
Fe      4   +3    4 f     0.3333     0.6667    0.19091(2)    1.        0   
Fe      5   +3   12 k  0.16886(4)  0.33772(8)  0.89083(1)     1.         0   
O       1    -2    4 e        0              0           0.1514(2)      1.         0   
O       2    -2    4 f      0.6667     0.3333      0.0554(2)      1.         0   
O       3    -2    6 h    0.1819(2)  0.3639(6)   0.25             1.         0   
O       4    -2    12 k   0.1564(2)  0.3127(4)   0.05252(7)    1.       0   
O       5    -2    12 k   0.5039(3)  0.0078(5)   0.15093(8)    1.       0
当Add Atom到第二个铁原子时,发现SOF和其他的不同,是0.5,不知道这个该如何表示,是occupancy么?这个学期刚刚开始学习晶体学,对这些术语暂时还是混沌状态……暂时修改成了occupancy为0.5后,输入第二个Fe原子会提示Chosen position is within the specified tolerance(1.0?) of a symmetry copy of itself.可是将occupancy修改回1后,还是出现同样的提示……其他的原子在输入时都没有出现任何问题……
第二个问题更晕一点~就是在提出提示后,点了Yes,然后总算是建了一个不知道对错的晶胞,按照教程上,应该Build->Symmetry->premitive cell,可是本应是premitive cell的位置变成了灰色不可选的Rhombohedral Representation,是不是因为建立的已经是最简单格子,所以不用转换为原始晶胞了呢?
还希望众位大牛踊跃发言,介绍一下经验啊……
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souledge

专家顾问 (著名写手)

咋没人回复俺的帖子呢,其实俺的中心涵义就是,这个ICSD中的SOF值,应该怎么用……似乎大概不难吧~至于那个报错信息,以后碰到了再说吧……
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2010-03-19 17:15:56
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identation

金虫 (著名写手)

★ ★
souledge(金币+1):谢谢参与
zxzj05(金币+1):鼓励讨论! 2010-03-20 04:50
就是正常输入原子坐标啊,那些什么SOF之类的都不用管,occupancy也不用管
3楼2010-03-20 02:47:59
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souledge

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by identation at 2010-03-20 02:47:59:
就是正常输入原子坐标啊,那些什么SOF之类的都不用管,occupancy也不用管

感谢回复,再进一步问,比如我查到了 0.7Ti  0.3W  C  这个晶体,是225 Fm-3m结构,并且也可以查到晶格参数大概是四点几的样子。

不过ICSD中的数据,却是Ti和W都在0,0,0位置,只是Ti的SOF是0.7,而W的是0.3。那么我该如何建立晶格呢?尝试过先用Ti和C按照已知结构建立晶体模型,然后点一下Ti原子,把它的composition修改为70% Ti和30% W。不过,用来做DOS的计算啥的时候,则会提示任务失败,失败原因是什么上旋下旋电子不相等之类……而不修改添加W的时候,计算没有问题~
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2010-03-21 23:10:13
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guifan

木虫 (著名写手)

★ ★
souledge(金币+1):谢谢参与
souledge(金币+1):哇~受教了! 2010-03-22 12:39
qasd(金币+1):xiexie 2010-03-22 20:43
出现“上旋下旋电子不相等”时,可以在计算时选上自旋计划,这样就不会有警告了
5楼2010-03-22 00:24:05
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souledge

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by guifan at 2010-03-22 00:24:05:
出现“上旋下旋电子不相等”时,可以在计算时选上自旋计划,这样就不会有警告了

不过,还得说的是,不是警告,而是job被停止……呃~今天再试试去~很感谢~
思想重于技巧,内涵重于表象
6楼2010-03-22 12:40:25
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