24小时热门版块排行榜    

查看: 1498  |  回复: 1
当前主题已经存档。

qiangwxr

木虫 (小有名气)


[交流] 【原创】关于DMol3能量计算不收敛的问题

结构优化时出错,无法收敛,相信很多人都碰到过。看过一些贴子,一般都是设定Smearing(逐渐减小),或逐渐增加计算精度。今天仔细分析了一下,有所发现。简单来说,就是基组的选择很重要,DNP效果比较好。下面详细说明一下,大家看看是否有道理:

1. 面临的问题:结构优化是不收敛,提示信息如下:
Message: SCF not converging. Choose "Use Smearing" on DMol3 SCF panel
or set "Occupation  Thermal" in the input file.
You may also need to change spin or use symmetry.

2. 结构优化本身没有问题,是单点能量计算不能收敛,所以用单点能量计算来分析比较。选择的体系是含有一个金属原子的体系(烷基铝与一个有机分子)。以前咨询过创腾科技的工程师,含有金属的体系,能量计算不容易收敛,需要设定Smearing。但有时候设的太低还是不能收敛,设高了又怕所得结构不合理。

3. 按照一些网友和自己的经验,可以采用逐渐增加精度的方法来消除不收敛问题。但今天发现一个“奇怪”的现象:用Fine精度单点能量能很快收敛,而用Coarse精度单点能量在迭代150次仍不能收敛。

4. 通过仔细分析,猜测低精度不能收敛的原因:基组(Basis set)或轨道截断(Orbital cutoff)的选择很重要。以前计算时选择精度都是通过在Setup标签下选择Fine、Medium或Coarse,没有设置具体的参数。DMol3的单点能量计算的Electronic标签下有四个地方可以分别设置精度,为了查看每个设置对计算收敛的影响,做如下对比试验:
Integration accuracy   SCF tolerance     Basis set   Orbital cutoff quality   SCF iterations   Energy (Ha)
Coarse                 Coarse        DN        Coarse        >150       
Coarse                 Coarse        DN        Fine        >150       
Coarse                 Coarse        DNP        Coarse        23        -2996.855992
Coarse                Coarse        DNP        Fine        21        -2996.873912
Fine                   Coarse        DNP        Fine        20        -2996.866641
Coarse                 Fine        DNP        Fine        26        -2996.873911
Fine                    Fine          DNP        Fine        27        -2996.866643

5. 通过上面的比较计算,可以发现基组的选择很重要,只要基组选择为DNP,其它三项都为Coarse也能很快收敛,不过所得能量值会有差别。如果为了快速优化结构,这三项可以先用低精度,待得到最低能量构象后,再提高精度。

[ Last edited by qiangwxr on 2010-3-16 at 15:35 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漂泊四方

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
非常感谢楼主提供的系统测试。
虽然原因不是很清楚,但是从结果来看还是比较有效的。
我与我纠缠久
2楼2010-03-16 15:55:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qiangwxr 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 8/400 2026-08-01 20:37 by Kddn1pB6pAzX
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 10/500 2026-08-01 20:37 by Kddn1pB6pAzX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 12/600 2026-08-01 20:31 by Kddn1pB6pAzX
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 12/600 2026-08-01 20:23 by Kddn1pB6pAzX
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 9/450 2026-08-01 20:10 by Kddn1pB6pAzX
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jzg3xk1po8 2026-07-31 8/400 2026-08-01 20:03 by Kddn1pB6pAzX
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 10/500 2026-08-01 19:53 by Kddn1pB6pAzX
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 9zw1gfyi7x 2026-08-01 8/400 2026-08-01 18:50 by Kddn1pB6pAzX
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 9zw1gfyi7x 2026-08-01 9/450 2026-08-01 18:43 by Kddn1pB6pAzX
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 9zw1gfyi7x 2026-08-01 6/300 2026-08-01 18:37 by Kddn1pB6pAzX
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 9zw1gfyi7x 2026-08-01 6/300 2026-08-01 18:31 by Kddn1pB6pAzX
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 8/400 2026-08-01 18:22 by Kddn1pB6pAzX
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 9zw1gfyi7x 2026-07-31 11/550 2026-08-01 18:17 by Kddn1pB6pAzX
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 7/350 2026-08-01 17:42 by Kddn1pB6pAzX
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 19/950 2026-08-01 15:18 by 40862026
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 18/900 2026-07-31 18:35 by lzchaihuo
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
[基金申请] 准备明年的基金了 +5 Tide man 2026-07-27 5/250 2026-07-28 09:25 by newfuzzy1
信息提示
请填处理意见