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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】请问杂化密度泛函和基组对单个化合物的影响问题
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lorna639

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】请问杂化密度泛函和基组对单个化合物的影响问题

最近我用密度泛函方法如：B3LYP，B3PW91和B3P86等方法研究了一些脂族醇分子的键离解能，但是审稿人给的审稿意见如下：

The effects of hybrid density functional and basis sets on individual compound should also be addressed and discussed, since the emphasis on the "mean absolute deviation" across 20 molecules could mask the details on rather different systems.

请问如果讨论杂化密度泛函和基组对单个化合物的影响啊，我一点头绪也没有啊，请大家帮忙啊
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1楼2010-03-15 11:14:46
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+5): 2010-03-15 14:11
如果你的体系或者类似的体系也行，有别人做过计算，发表在比你要发表的杂志高很多的期刊上，你需要引用说明，以证明你为什么用这个方法和基组的合理性，当然，引用review的文章更加有效。如果类似的体系没有别人做或者文章不显眼，那么你就需要换方法和基组，然后互相对比一下，以证实你的体系对于方法和基组不是很敏感，结果都差不多，当然如果有实验数据那是最好不过的。如果能量的实验数据没有，至少也要跟单晶结构对比一下，证明你优化的结果至少从构型构象上符合实际，也多少有一点说服力，然后在你优化的结构的基础上，用更高的方法和基组做单点算，文章直接采用新的数据或者说明更高的方法和基组对你的结果影响不大。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-03-15 11:41:06
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lorna639

木虫 (著名写手)
请问如何具体讨论杂化密度泛函和基组对单个化合物的影响啊
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3楼2010-03-15 21:25:57
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
yjcmwgk(金币+1): 2010-03-16 13:51
至少你可以对单晶啊——计算构象和单晶构象比较一下啊。
主要是键长，其次是键角，再次是二面角。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-03-16 00:24:03
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lorna639

木虫 (著名写手)
现在的问题是我有键离解能的实验数值，通过计算值与实验值的比较后，发现计算方法和基组对结果的影响很大，结果审稿人让我讨论密度泛函方法和基组对单个化合物的影响。我觉得他的意思应该是让讨论方法和基组对单个化合物键离解能的影响，不是键长等特性的，因为在文章中我也没有找到键长的实验数据，所以我没有提到键长。所以现在是如何讨论方法和基组对键离解能的影响，难道就是针对某一个化合物，拿几种方法的结果进行比较？
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5楼2010-03-16 08:28:54
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