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tiechong

金虫 (著名写手)

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[交流] 【讨论】NBO bond order

在网上看到这个NBO输出:
Natural Bond Order: (total/covalent/ionic)
Atom 1 2 3 4 5 6
---- ------ ------ ------ ------ ------ ------
1. H t 0.0020 0.0000 0.9959 0.0000 0.0000 0.0000
c --- 0.0000 0.5787 0.0000 0.0000 0.0000
i --- 0.0000 0.4172 0.0000 0.0000 0.0000
2. H t 0.0000 0.0050 0.9928 0.0000 0.0000 0.0000
c 0.0000 --- 0.5664 0.0000 0.0000 0.0000
i 0.0000 --- 0.4265 0.0000 0.0000 0.0000
3. N t 0.9959 0.9928 0.7691 1.2422 0.0000 0.0000
c 0.5787 0.5664 --- 0.7519 0.0000 0.0000
i 0.4172 0.4265 --- 0.4903 0.0000 0.0000
4. C t 0.0000 0.0000 1.2422 0.0000 1.7904 0.9674
c 0.0000 0.0000 0.7519 --- 1.0967 0.7956
i 0.0000 0.0000 0.4903 --- 0.6937 0.1719
5. O t 0.0000 0.0000 0.0000 1.7904 2.2076 0.0000
c 0.0000 0.0000 0.0000 1.0967 --- 0.0000
i 0.0000 0.0000 0.0000 0.6937 --- 0.0000
6. H t 0.0000 0.0000 0.0000 0.9674 0.0000 0.0275
c 0.0000 0.0000 0.0000 0.7956 0.0000 ---
i 0.0000 0.0000 0.0000 0.1719 0.0000 ---

NBO 键级分析还可以分共价键和离子键,我试来试去都没弄出来
用POP=NBOREAD分析得到的键级里也没有NBO键级,
而且得出的Atom-atom overlap-weighted NAO bond order和MO atomic valencies居然还有很多负数,负数的键级应该是没有物理意义的

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1楼 2010-03-14 12:35:02

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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

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专业: 理论和计算化学
管辖: 计算模拟

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-15 14:17

nbo 3没有这个功能。先产生.47文件：
# ... pop=nboread

...

$nbo archive $end

然后编辑gaussian产生的file.47文件，加上nrt选项，再用gennbo 5进行计算。nbo键级的结果在输出文件的最后。

nrt计算不是很稳定，经常会遇到找不到参考结构的错误。这时候换个小点的基组也许可以解决。

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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地

2楼2010-03-14 14:07:15

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