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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】优化时构型的确定
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zxwasd

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化时构型的确定

大家好!我是新手，最近在用gauss优化分子的结构时，得出的结论（主要是电荷和偶极距）与文献中的总是不同，我用的方法和基组与文献的一致，但结果差别很大，比较了一下优化构型，可能是输入的初始结构不同造成的，但我如何才能给出正确或最稳定的分子构象呢，用什么方法可以判断或得到？
        我优化的是氨基酸分子，在gaussview中有一个按钮可以直接给出相应氨基酸的构型，但结果与文献不同，这是为何？请大家不惜赐教，不胜感激！！！
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1楼 2010-03-14 10:49:51
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LuPeng5366

新虫 (著名写手)

牛牛
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
改变初始结构，重新优化！
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自信，坚强，勇敢。
2楼2010-03-14 10:57:24
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zxwasd

金虫 (小有名气)
自己顶起，希望得到高手的帮助！
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3楼2010-03-14 11:04:59
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467266420

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zxwasd at 2010-03-14 10:49:51:
大家好!我是新手，最近在用gauss优化分子的结构时，得出的结论（主要是电荷和偶极距）与文献中的总是不同，我用的方法和基组与文献的一致，但结果差别很大，比较了一下优化构型，可能是输入的初始结构不同造成的， ...

gview给出的结构几乎可以说没做优化，你肯定得再用高水平的方法做优化。另外做个SCAN可以帮助你找到最稳定的分子构象。
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4楼2010-03-14 11:15:49
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zxwasd

金虫 (小有名气)
非常感谢你，我试一下啊！
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5楼2010-03-14 13:33:55
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-15 14:15
引用回帖:
Originally posted by zxwasd at 2010-03-14 13:33:55:
非常感谢你，我试一下啊！

高斯是个傻瓜程序，它只会在输入结构的附近找寻一个相对稳定的点，作为最优化结构，所以输入构型十分重要。
你可以再CHEM3D里面先对分子进行MM优化，多看几个相对稳定构型，然后根据自己的经验选择相对可能的构型作为输入文件
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2010-03-14 16:22:00
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zxwasd

金虫 (小有名气)
谢谢！尝试一下啊，楼主！
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7楼2010-03-14 18:07:41
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