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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】NEB方法，计算势垒
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zd777

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】NEB方法，计算势垒

NEB（nudged elastic band）是一种已知反应物和产物来寻找鞍点和最小能量路径的方法。用NEB可以计算其扩散路径或扩散势垒、过渡态。

查了一些资料，一般都是用NEB方法计算扩散，吸附的。

有人做过固体的高压结构相变中，用NEB 方法，来计算其反应路径（即中间过渡态）及势垒吗？
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1楼 2010-03-13 15:46:17
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lfhuang

木虫 (著名写手)
★ ★
wuchenwf(金币+2):谢谢 2010-03-13 21:38
关于NEB方法的原始文献及相应模拟方法可以查看：
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=298464
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先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
3楼2010-03-13 19:37:06
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普通回帖

lfhuang

木虫 (著名写手)
★
zd777(金币+1):谢谢参与
相变下，材料原胞形状保持不变乎？
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先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
2楼2010-03-13 19:34:43
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zd777

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lfhuang at 2010-03-13 19:34:43:
相变下，材料原胞形状保持不变乎？

多说的相变，材料的原胞都发生变化了

我现在也正查些资料，好像是要求初始的原胞矩阵和末态的矩阵相同。

原胞变化的情况，NEB方法还适用吗？

我刚接触这个方法，在网上查了些资料，不知道下面的步骤对不对？

这个方法是不是先要建立00 01 02 ...0x 个目录，

然后执行 interpolate.pl  产生出各个 POSCAR，

再把这些poscar放近各个目录

准备好INCAR KPOINTS, 和POTCAR，

然后执行vasp 运算， 对吗？
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4楼2010-03-13 20:18:17
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2008xuxy

至尊木虫 (著名写手)
★
zd777(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by zd777 at 2010-03-13 15:46:17:
NEB（nudged elastic band）是一种已知反应物和产物来寻找鞍点和最小能量路径的方法。用NEB可以计算其扩散路径或扩散势垒、过渡态。

查了一些资料，一般都是用NEB方法计算扩散，吸附的。

有人做过固体的高压 ...

帮顶
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5楼2010-03-13 20:32:31
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漂泊四方

金虫 (小有名气)
★
zd777(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by zd777 at 2010-03-13 20:18:17:


多说的相变，材料的原胞都发生变化了

我现在也正查些资料，好像是要求初始的原胞矩阵和末态的矩阵相同。

原胞变化的情况，NEB方法还适用吗？

我刚接触这个方法，在网上查了些资料，不知道下面的步骤 ...

NEB 变单胞的方法 Vasp TST Tools 里面有，但是没有对用户开放。

可以参考
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/neb/
最后一行

Standard Parameters
Parameter Default Value Description
ICHAIN 0 Indicates which method to run. NEB (ICHAIN=0) is the default
IMAGES  Number of images in the band, excluding endpoints
SPRING -5.0 eV/A2 Spring force between images; negative value turns on nudging
LCLIMB .TRUE. Flag to turn on the climbing image algorithm
LTANGENTOLD .FALSE. Flag to turn on the old central difference tangent
LDNEB .FALSE. Flag to turn on modified doubble nudging

NEBCELL* .FALSE. Flag to turn on NEB for changing cell. Used with ISIF=3
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

* not yet availble for public use
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我与我纠缠久
6楼2010-03-13 22:31:39
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guifan

木虫 (著名写手)
★
zd777(金币+1):谢谢参与
没用过，也想学学
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7楼2010-03-13 22:58:46
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wei.ji

木虫 (正式写手)
★
zd777(金币+1):谢谢参与
结构相变用什么neb，直接把相图画出来就是了。。。
引用回帖:
Originally posted by zd777 at 2010-03-13 15:46:17:
NEB（nudged elastic band）是一种已知反应物和产物来寻找鞍点和最小能量路径的方法。用NEB可以计算其扩散路径或扩散势垒、过渡态。

查了一些资料，一般都是用NEB方法计算扩散，吸附的。

有人做过固体的高压 ...

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http://sim.phys.ruc.edu.cn
8楼2010-03-14 00:13:50
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zd777

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 漂泊四方 at 2010-03-13 22:31:39:


NEB 变单胞的方法 Vasp TST Tools 里面有，但是没有对用户开放。

可以参考
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/neb/
最后一行

Standard Parameters
Parameter Default Value Descrip ...

非常感谢，

我看了vtstscripts 那些脚本，

因为我们要在01 02 ... 0x文件夹中给出POSCAR

是不是用NEB方法，必须知道相变的大致路径？
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9楼2010-03-14 11:25:58
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zd777

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wei.ji at 2010-03-14 00:13:50:
结构相变用什么neb，直接把相图画出来就是了。。。

我的问题是这样的，假如我要计算石墨和金刚石的势垒，可以用NEB吗？

直接画相图？你指的零温下，P-v相图吗？
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10楼2010-03-14 11:27:40
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