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zhangwc5020

银虫 (小有名气)

[交流] 【分享】由晶体数据得到计算模型

1. 文献的supporting information中给了cif文件,用gaussview或chem3D打开即可,但是有时GV不能打开,而chem3D打开的只是单核结构,就不能满足模型要求。我向大家推荐ORTEP软件,他不但可以打开cif,还能将单核转化为双核结构(网上可下载):打开ortep软件,菜单上的contents里有个grow fragment,点击选中auto mode即可。
2. 如果文献中只给了ccdc号,ok,大家可以上ccdc的网站,通过e-mail向这个晶体库索取。http://www.ccdc.cam.ac.uk/cgi-bin/catreq.cgi,很快的
3.有些文献的晶体结构只给了pdf格式的晶体坐标描述,我不知怎么才能将其转化为模型,以便计算,请高手赐教!感激
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faqianliu

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
感谢分享,现在正使用汪洋的晶体转换软件,不知道ortep效果如何,有用过的说一下
2楼2010-03-13 15:52:27
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zhangwc5020

银虫 (小有名气)

问题补充

我在网上查到了,pdf格式的晶体坐标是分子坐标,需要将它转化为直角坐标,然后,就可以了,转化软件是Cartes-分子和晶体结构坐标编辑器 V1.3.0,网址在http://www.ddooo.com/softdown/30746.htm#,感谢zhangmt  
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3楼2010-03-13 15:55:33
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