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shinee

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何按自己意愿固定坐标轴方向 已有1人参与

大家好,想问下gaussview构造完分子后,点击Cartesian Axes,自动的显示出了坐标轴,但是有时候不是自己想要的坐标轴方向,如何按自己意愿固定坐标轴xyz方向呢?
谢谢。
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

★ ★ ★
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yjcmwgk(金币+2): 2010-03-12 13:38
保存为xyz下坐标文件,
然后自己旋转坐标轴。

我比较笨,就是这么干的.

原理是数学中的坐标轴旋转于平移


如果谁有比较聪明的方法,交流一下....
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2010-03-11 12:23:42
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
如果分子有一定对称性, gv 选择分子主轴为z轴, 这个好像改不了.
做好后可以到其他程序中修改, 比如vmd 里面的move 命令.
3楼2010-03-11 13:15:25
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+3):可是nosymm往往是我们很不情愿的选择 2010-03-12 13:38
首先,没有这个必要——详情请去看sobreva的专题。
其次,非要做的话,在gview里按笛卡尔坐标形式存成mol文件,去hyperchem里面打开,按你想要的方向去旋转,保存。然后手工修改文件,在计算命令那一行后面加上nosymm关键字,这样gaussian就不去自动旋转坐标轴了。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-03-11 19:47:05
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

我尝试使用hyperchem旋转过, 但是那个不能精确控制,

可以使用旋转矩阵进行操作,这个可以精确控制
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
5楼2010-03-12 22:40:37
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★ ★
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yjcmwgk(金币+3): 2010-03-14 12:16
按住alt坐标轴就不会动了。然后拖动鼠标并结合ctrl/shift键来调整分子相对于坐标轴的朝向和位置即可。如果要精确控制,比如某个键必须平行于坐标轴之类,可以在适当位置做辅助原子,调整夹角、距离来实现。
6楼2010-03-13 01:53:38
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xuhu_11

金虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
学习了
--正想问这个问题的
千万别考博!
7楼2010-04-09 23:24:28
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