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cecilia801537

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何用本地blast寻找我的基因组中有没有相似基因?

我把自己测得的一个基因组作为数据库,再从ncbi上下载了一些其他物种的感兴趣的基因,我想看看我的基因组中有没有和它们相似的基因,应该怎么做?

本地blast的操作我会,但是blast之后的结果总是只有二三十bp左右的序列,我想这个比对的窗口长度是一个基因的长度,该怎么办呢?
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guixiaohua

禁虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 2010-03-11 13:38
本帖内容被屏蔽

2楼2010-03-11 10:16:01
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cecilia801537

铁虫 (小有名气)

★
1949stone(金币+1): 2010-03-11 13:38
bioedit比对出来一样是那种很短的相似序列啊 20-30bp左右的
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3楼2010-03-11 10:37:29
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cecilia801537

铁虫 (小有名气)

没人知道吗?
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4楼2010-03-11 15:31:11
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cecilia801537

铁虫 (小有名气)

求助啊~~~~
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5楼2010-03-11 20:23:40
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