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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何将基因在染色体中定位
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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何将基因在染色体中定位

在克隆葡萄中某种酶的基因实验中，我通过race得到三种不同cdna全长序列，三种序列只存在片段缺失的差别，近两千个bp中只有三个位点突变的差别，而且在葡萄基因组数据库中，以所得序列进行搜索，只得到染色体上一个相似片段。因此我怀疑三种序列是由基因的转录过程的不同剪切方式出现的，所以我想通过将基因在葡萄染色体上定位，得到基因的位置和数量，证明我的设想---这种酶的基因通过不同的剪切方式，调控酶的不同形式的表达。希望大家指点一下
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1楼 2010-03-10 16:41:32
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)
试试southern杂交，可以确定基因组中有几个拷贝
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2楼2010-03-10 20:52:11
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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)
原位杂交怎么样呀
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3楼2010-03-10 22:42:12
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yucheng9255

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
xnbioinfor(金币+1):谢谢 2010-03-11 07:53
原位杂交没做过，听说挺难得
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4楼2010-03-10 22:48:47
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silicare

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★
xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
xnbioinfor(金币+2):谢谢 2010-03-11 12:11
原位杂交是组织水平的，你可以在拼接位置设计探针，试一下，看看有没有
染色体定位没什么意义

你要找的是剪切变体，只需要先从gt。。ag找起就ok了
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5楼2010-03-11 08:37:04
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主
xnbioinfor(金币+2):能麻烦你再解释一下怎么检测是测序的跳读还是真正的剪切变体吗？ 谢谢 2010-03-11 12:42
就是先用简单的生物信息学方法分析一下你的序列，看看到底是测序的跳读还是真的是剪切变体，

然后再做功能性研究，研究出剪切变体的功能，你就可以博后出站了，所以很 有难度，你要有准备
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6楼2010-03-11 12:23:02
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
★
xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
FISH做染色体定位，
Real-time PCR检测一下不同剪接本的表达差异
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
7楼2010-03-11 13:05:41
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
我也觉得你想确定是不是剪接不同，跟染色体定位不相关，做染色体定位没有意义
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8楼2010-03-11 13:30:55
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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)
那我怎么证明是剪接不同呢？ 望指点迷津
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9楼2010-03-11 13:33:27
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