24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 709  |  回复: 8
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 xnbioinfor 的 10 个金币 ,回帖就立即获得 1 个金币,每人有 1 次机会

xnbioinfor

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何将基因在染色体中定位

在克隆葡萄中某种酶的基因实验中,我通过race得到三种不同cdna全长序列,三种序列只存在片段缺失的差别,近两千个bp中只有三个位点突变的差别,而且在葡萄基因组数据库中,以所得序列进行搜索,只得到染色体上一个相似片段。因此我怀疑三种序列是由基因的转录过程的不同剪切方式出现的,所以我想通过将基因在葡萄染色体上定位,得到基因的位置和数量,证明我的设想---这种酶的基因通过不同的剪切方式,调控酶的不同形式的表达。希望大家指点一下
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaocy8903

木虫 (知名作家)

试试southern杂交,可以确定基因组中有几个拷贝
2楼2010-03-10 20:52:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xnbioinfor

铜虫 (小有名气)

原位杂交怎么样呀
3楼2010-03-10 22:42:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yucheng9255

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xnbioinfor(金币+1):谢谢 2010-03-11 07:53
原位杂交没做过,听说挺难得
4楼2010-03-10 22:48:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主


xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
xnbioinfor(金币+2):谢谢 2010-03-11 12:11
原位杂交是组织水平的,你可以在拼接位置设计探针,试一下,看看有没有
染色体定位没什么意义

你要找的是剪切变体,只需要先从gt。。ag找起就ok了
5楼2010-03-11 08:37:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主

xnbioinfor(金币+2):能麻烦你再解释一下怎么检测是测序的跳读还是真正的剪切变体吗? 谢谢 2010-03-11 12:42
就是先用简单的生物信息学方法分析一下你的序列,看看到底是测序的跳读还是真的是剪切变体,

然后再做功能性研究,研究出剪切变体的功能,你就可以博后出站了,所以很 有难度,你要有准备
6楼2010-03-11 12:23:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)


xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
FISH做染色体定位,
Real-time PCR检测一下不同剪接本的表达差异
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
7楼2010-03-11 13:05:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)


xnbioinfor(金币+1):谢谢参与
我也觉得你想确定是不是剪接不同,跟染色体定位不相关,做染色体定位没有意义
8楼2010-03-11 13:30:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xnbioinfor

铜虫 (小有名气)

那我怎么证明是剪接不同呢? 望指点迷津
9楼2010-03-11 13:33:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xnbioinfor 的主题更新
提示: 如果您在30分钟内回复过其他散金贴,则可能无法领取此贴金币
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见