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entomology557

铁杆木虫 (知名作家)

[交流] 【求助/交流】30金币急求一个有关go分类的问题,解决立马放分

目前做了一个虫子的转录组,回来2万多条序列。
现在想将这些序列对应基因的功能和蚜虫的做比较。

需要比较的功能种类也不是太多,大概50来种,分别属于biological process,cellula
process,molecular process。

也就是说,目前要做的就是把这两万多条序列中属于这50多种功能的分别有多少条序列
统计出来即可。

有没有较为方便的方法可以做这个事情?用blast2go可行吗,感觉跑起来会很慢很慢

十分感谢指点/bow
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生物进化基本常识:一定范围内,选择压力越大,要么进化的越快来适应这种压力,或者直接被淘汰。
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entomology557

铁杆木虫 (知名作家)

生物进化基本常识:一定范围内,选择压力越大,要么进化的越快来适应这种压力,或者直接被淘汰。
2楼2010-03-10 23:20:30
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exit147

木虫 (著名写手)

entomology557(金币+5):已经注册了,先给5个,能解决问题全部发放^_^,3xs 2010-03-11 15:55
我刚做过这个,你可以用博奥的MAS系统解决问题。在它网站上注册一下就可以用了。这个系统允许一次性最多输入2000条芯片序列号
http://bioinfo.capitalbio.com/mas3/

[ Last edited by exit147 on 2010-3-11 at 14:18 ]
秋风生渭水,落叶满长安。
3楼2010-03-11 14:17:14
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entomology557

铁杆木虫 (知名作家)

只有果蝇,sigh,并且不是太好用啊,555
生物进化基本常识:一定范围内,选择压力越大,要么进化的越快来适应这种压力,或者直接被淘汰。
4楼2010-03-12 10:07:49
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