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467266420

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】过渡态能量精确计算

大家都知道用G3和CBS-Q可以计算出的能量与实验值较为吻合,这几天我在用G3和CBS-Q算过渡态的能量(之前都是用CCSD(T)算TS),算出来的TS全变成了稳定结构,难道Gn和CBS方法不能用来计算过渡态的能量?望高手解答
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easygeton

铜虫 (小有名气)

★ ★
467266420(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+1): 2010-03-09 18:11
467266420(金币+5):我试过手动算过渡态的动力学数据,有点繁琐,不过效果不错哈 2010-03-30 10:08
高斯里面G3和CBS是组合方法,就是说包括几个连续的计算步骤,默认是先优化极小点,再计算单点,所以过渡态会被优化成极小点。解决办法是参考G3的原始文献里面的步骤,手动算。但是要注意一点,G3是按照热力学的数据拟合的,没有考虑过渡态这些动力学的数据,所以不能肯定G3算过渡态和热力学性质一样准。
2楼2010-03-09 13:50:39
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467266420

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by easygeton at 2010-03-09 13:50:39:
高斯里面G3和CBS是组合方法,就是说包括几个连续的计算步骤,默认是先优化极小点,再计算单点,所以过渡态会被优化成极小点。解决办法是参考G3的原始文献里面的步骤,手动算。但是要注意一点,G3是按照热力学的数 ...

不论热力学和动力学,计算能量应该是没有差别的,文献中式有人用Gn的方法算过渡态的
3楼2010-03-09 14:27:56
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467266420

铁杆木虫 (著名写手)

该问题本人已近整明白,CBS-n和Gn确实可以计算过渡态的能量,只是输入时要做调整,不过此话题似乎少人问津,有点遗憾。
4楼2010-03-11 08:54:02
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kingkanglee

新虫 (正式写手)


467266420(金币+1):谢谢参与
467266420(金币+1):哈哈,灌水也辛苦了 2010-03-30 10:04
aylayl08(金币-2):禁止无意义回帖,扣回所得 2010-03-31 09:01
恭喜明白了
两岸共同市场就是一中市场。
5楼2010-03-29 20:23:25
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉


467266420(金币+1):谢谢参与
467266420(金币+3):Gn也可以控制直接算单点,不过ccsd更容易上手的 2010-03-30 10:01
引用回帖:
Originally posted by 467266420 at 2010-03-09 11:06:00:
大家都知道用G3和CBS-Q可以计算出的能量与实验值较为吻合,这几天我在用G3和CBS-Q算过渡态的能量(之前都是用CCSD(T)算TS),算出来的TS全变成了稳定结构,难道Gn和CBS方法不能用来计算过渡态的能量?望高手解答

cbs gn里面都含有优化步骤,最好直接用CCSD(T)算能量吧
技术博客:http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
6楼2010-03-29 21:16:18
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alick1102

铜虫 (小有名气)


467266420(金币+1):谢谢参与
467266420(金币+2):确实Gn有时可能算得不准,但在效率和时间上考虑,是个很好的方法 2010-03-30 09:55
467266420(金币+1):少加了 2010-03-30 10:02
引用回帖:
Originally posted by 467266420 at 2010-03-09 14:27:56:

不论热力学和动力学,计算能量应该是没有差别的,文献中式有人用Gn的方法算过渡态的

我觉得在算过渡态时应该没有稳态算的准。G3里面有个high level correction,就是以alpha, beta电子的数目为基础做了一个校正。但是过渡态时往往涉及到一些很复杂的态,可能在做较准的时候会有点问题的。
到了博士的时候才知道,科学也不过是为了吃饭的。
7楼2010-03-29 22:52:59
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hzfish

金虫 (正式写手)


467266420(金币+1):谢谢参与
467266420(金币+3):6-9个重原子还是可以的哈 2010-03-30 10:03
引用回帖:
Originally posted by 467266420 at 2010-03-09 11:06:00:
大家都知道用G3和CBS-Q可以计算出的能量与实验值较为吻合,这几天我在用G3和CBS-Q算过渡态的能量(之前都是用CCSD(T)算TS),算出来的TS全变成了稳定结构,难道Gn和CBS方法不能用来计算过渡态的能量?望高手解答

G3和CBS—Q计算能量时有自己规定的优化的方法,和你优化过渡的方法不一定一致。

G3和CBS—Q计算能量对小体系比较准确,很难用于大分子体系。
8楼2010-03-30 09:10:52
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