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铁虫 (初入文坛)

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[交流] 【推荐】基于HRM技术的SNP、突变和甲基化检测

现阶段,大家检测SNP时都用一贯的检测方法,包括测序,探针还有DHPLC等等,而甲基化大多用MSP.至于HRM技术(高分辨率溶解曲线技术)并不为大家所熟知,有两个原因:1)适合做HRM技术的仪器太少了,而且在国内的普及程度不高,具我了解能够做HRM的有Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 6000,ABI 7500 Fast和ABI7900HT Fast,Idaho LightScanncer.其中罗氏的480在其软件分析上是做的最好的.2)HRM的实验灵敏度太高,影响实验因素过多,很多人都做了,但是就是做不出来.因此就放弃,就换用其他比较成熟的方法.殊不知,HRM技术的检测方法有其他技术难以比拟的优势，不仅能实现高通量和高精度的同时,PCR和荧光定量在同一管内进行,能够有效避免假阳性.
作为新一代的遗传扫描工具,HRM具有"简,效,快,廉"等其他技术难以比拟的优势:
简:无需序列特异性探针,不受碱基位点局限,同时检出已知或未知突变、SNP和甲基化位点：闭管操作，避免交叉污染。
效：最低检测0.1%-0，01%的突变或异常甲基化，检测SNP灵敏度和特异性均为100%。
快：1次同时不多于384个样本，在60-90分钟内完成检测。
廉：简化操作步骤、降低人工和试剂成本，费用远少于测序、Taqman探针等方法。
HRM技术特别适用于样本量多、检测位点较少的SNP、突变或甲基化分析，是不同于基因芯片检测方法（检测位点多，样本少）的高通量方法。同时，也是基因芯片筛选后的多个基因在更多标本中验证的最佳方法。

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