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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】蛋白定量的数据分析
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kevin.wee

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】蛋白定量的数据分析

最近用WB 检测Ubiquitin在C57小鼠大脑内表达变化，内参选用GAPDH,检测结果如图。
而后用Quantity one 软件分析灰度值结果如
         GAPDH           ubiquitin                Ubi/GAPDH       
S1                a1               b1
S2                a2               b2
S3                a3               b3
S4                a4               b4
S5                a5               b5

V1                a6               b6
V2                a7               b7
V3                a8               b8
V4                a9               b9
V5                a10             b10

在比较sample和control之间Ubiquitin表达变化时，需要用GAPDH对于结果进行校正
即S(Ubi/GAPDH)/V(Ubi/GAPDH)
现在我对这个Ubi/GAPDH 产生了疑问，请问各位虫友们这个average（Ubi/GAPDH)是先比较再求和求平均，还是应该先求和再取平均值做比较呢
即：先比再求平均数 (b1/a1+b2/a2+...+b5/a5)/5
       先求平均数再比 (b1+b2+...+b5)/(a1+a2+...+a5)
应该选择哪种计算方式呢，之间意义有何区别呢？数学学的不好，还请高人指点 ^_^

怎么不能发图片了，各位虫友指导下，我把图片发上来。

[ Last edited by kevin.wee on 2010-3-9 at 17:24 ]
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1楼 2010-03-05 11:35:48
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
编辑-----附件里面可以上传图片。
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Thank-you，so-blue.
2楼2010-03-05 13:31:42
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kevin.wee

金虫 (小有名气)
非常感谢虫友：susizheng
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3楼2010-03-09 17:25:16
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