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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】吸附分子的问题
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xuelian172

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】吸附分子的问题

请教高手，我想吸附个分子，文献中有顶位和桥位的说法，怎样把分子加到这个位置上呢？还有这个分子要怎么放置呢？谢谢大家！非常感谢
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1楼 2010-03-05 09:14:29
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study163

木虫 (正式写手)

天生我材
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ice_rain(金币+1):xiexie~ 2010-03-06 10:32
如果能计算出坐标的话可以按坐标填加。嫌麻烦可以直接去画，然后再调整到你要的方向和位置。
分子一般由多个原子构成，这么原子在桥位或其它位置以什么形式放着，得试一下，看哪种方式 能量低
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我的计算我做主
3楼2010-03-05 19:46:46
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topten-gg

银虫 (正式写手)
★
ice_rain(金币+1):xiexie~ 2010-03-06 10:32
复制 粘贴进去 然后调整位置就行了
为了准确可以标记两个键角 然后慢慢调整
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2楼2010-03-05 11:16:16
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04nylxb

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by topten-gg at 2010-03-05 11:16:16:
复制 粘贴进去 然后调整位置就行了
为了准确可以标记两个键角 然后慢慢调整

请教：如果将优化后的拟吸附的分子直接copy到切好面的金属的那个.xsd，分子位置时乱跑的……而且有时候是会有好几个分子在金属晶胞附近，是直接的copy优化好的分子，然后选优化好的晶胞+paste吗？
另，标记两个键角是指哪两个键角啊？是吸附的那个原子与金属原子之间、吸附原子与近邻原子之间的夹角吗？
谢谢啊
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集中精力发文章
4楼2010-03-07 21:40:43
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xuelian172

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by topten-gg at 2010-03-05 11:16:16:
复制 粘贴进去 然后调整位置就行了
为了准确可以标记两个键角 然后慢慢调整

您好！谢谢您的回复！我还想问下，这个键角是哪个原子之间的呢？而且怎么标记键角呢？谢谢！
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5楼2010-03-08 12:36:43
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