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铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何确定在一段DNA序列上是否存在基因?

如何确定在一段DNA序列上是否存在基因?
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 2010-03-06 20:51
推荐你看强伯勤 等翻译的《基因组》
钱要流动,人要走动
2楼2010-03-04 22:19:58
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 2010-03-06 20:52
Blast比对
或许分析一下启动子也可以
3楼2010-03-05 11:04:12
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zhouzhou_3006

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 2010-03-06 20:52
用VECTOR 软件分析下ORF
为梦想努力。
4楼2010-03-05 21:50:44
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gastrodia

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-03-05 11:04:12:
Blast比对
或许分析一下启动子也可以

问题太笼统,基因有很多种
我这里说一下功能基因的判断
如楼上所说,去blast一下,如果DNA来源原核物种,没有内含子,在Blast的时候能blast到其他物种的mRNA序列即可判断其有可能有功能基因的存在,然后去做基因克隆,拿到cDNA,再做功能鉴定

如果DNA来源真核物种,有内含子,在Blast的时候能blast到其他物种的mRNA序列,即可判断其有可能有功能基因的存在,以外显子区域为基础去克隆基因,其余同上
5楼2010-03-06 09:48:03
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djinyou

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可以去http://genes.mit.edu/GENSCAN.html在线预测
6楼2010-03-06 22:15:21
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yyn0452

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by djinyou at 2010-03-06 22:15:21:
可以去http://genes.mit.edu/GENSCAN.html在线预测

恩  这个方便快捷
7楼2010-03-06 22:20:04
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忘记将来

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by djinyou at 2010-03-06 22:15:21:
可以去http://genes.mit.edu/GENSCAN.html在线预测

收藏了,恩,不错
8楼2010-03-07 09:14:41
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wencul

铁杆木虫 (著名写手)

Metagross

可以去EST库 BLAST一下嘛 看它会不会有翻译的mRNA啊
Metagross
9楼2010-03-07 09:34:57
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民

记得这是个博士考题
钱要流动,人要走动
10楼2010-03-07 10:12:09
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