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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

[交流] 【求助】频率计算

1、linux 计算高斯,优化完了,频率中断,可以从check里面读取构象算频率吗?

从check文件中读取的时候提示
[root@localhost freq]# forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source
libpthread.so.0    0000003ED520E68D  Unknown               Unknown  Unknown
l1.exe             0000000000554FC2  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    0000003ED52064A7  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003ED46D3C2D  Unknown               Unknown  Unknown

2、是不是可以直接把优化的结构保存了然后算频率?
计算的时候top进程里面没有高斯的任务,但是终端也没提示出错。我不知道自己的题在不在算?是不是单计算频率的时候都会这样啊?
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
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lwei7336

木虫 (小有名气)

yyx19840628(金币+1):优化的结构重新opt的话往往不一定很快收敛。等于重新做了一遍。 2010-03-01 12:50
2. 应该是没有算,
碰到这种情况,我都是把优化好的结构拿出来,以其为初始,重算opt+freq
麻烦但管用,也费不了多少时间
2楼2010-03-01 10:24:41
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viger87

木虫 (正式写手)


yjcmwgk(金币+1): 2010-03-02 22:02
yyx19840628(金币+1):晕,你看看我的问题嘛。就是用check出现错误了啊,不是贴出来出错的提示了嘛。 2010-03-03 10:26
两种方法:
1.从log文件里把优化好的结构提取出来,继续算freq
2.利用chk文件继续计算freq
有花堪折直须折,末待花落空折枝!
3楼2010-03-01 19:26:17
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