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orangedp6597

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian 如何做ecd?很少有文献报道,是不是做的不准确?应该怎么写输入文件

打算用GAUSSIAN做一个化学物的光学异构体的ECD,不知道怎么写输入文件。请高手指教,谢谢!
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


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你说的是类似这样的用Gaussian模拟出来的CD谱吧?
转引自(J. Phys. Chem. A, 2010, 114, pp 1931–1938)这篇文章中的《Simulated Electronic Absorption and Circular Dichroic (CD) Spectra》这一节

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-3-1 at 13:24 ]
2楼2010-03-01 13:17:04
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orangedp6597

银虫 (小有名气)

对的

是的,但是不知道这样的图他是怎么做出来的,ECD输入文件如何做,输出的结果怎么看?哎呀,痛苦啊!
3楼2010-03-04 23:35:04
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上


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没有听说过高斯可以做ECD,这方面比较强大的还是ADF。
前途光明,出路难觅!
4楼2010-03-05 08:34:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-03-05 08:34:35:
没有听说过高斯可以做ECD,这方面比较强大的还是ADF。

高斯用TDDFT做ecd,不过需要数据后期自己处理。
5楼2010-03-05 11:43:38
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


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引用回帖:
Originally posted by orangedp6597 at 2010-03-04 23:35:04:
是的,但是不知道这样的图他是怎么做出来的,ECD输入文件如何做,输出的结果怎么看?哎呀,痛苦啊!

就是正常的TDDFT的输入文件。但是要用Rotate强度来代替原先的UV强度,自己用origin作图
6楼2010-03-05 11:58:15
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lightme36

银虫 (初入文坛)


yjcmwgk(金币+1): 2010-03-05 21:40
#P TD=(Nstates=15,Root=15) B3LYP/6-31g(d,p)  SCF=Tight Symm=Loose Int=UltraFine 等
如果你关注的态多的话,建议多设

结果分析在中本版手册中有介绍,在TD关键字下

[ Last edited by lightme36 on 2010-3-5 at 14:44 ]
7楼2010-03-05 14:43:31
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orangedp6597

银虫 (小有名气)

td 计算出来的结果如下
但是不知道选择哪个数据作图呢?
R(length)?还是选择 R(au)
用这个数值替换F的值就可以吗?
请高手指教?


Rotatory Strengths (R) in cgs (10**-40 erg-esu-cm/Gauss)
       state          XX          YY          ZZ     R(length)     R(au)
         1       277.9306   -173.9945     52.5753     52.1705      0.1107
         2        -9.0899      4.4107    -74.4225    -26.3672     -0.0559
         3       130.8978     54.3047      2.6476     62.6167      0.1328
         4         2.4803     -3.7995    -32.5524    -11.2905     -0.0239
         5      -114.9319      0.3682    -27.5276    -47.3638     -0.1005
         6        -2.2726    -16.9106      3.7395     -5.1479     -0.0109
         7       -28.9287     -1.5063     36.4926      2.0192      0.0043
         8         3.4081     -0.4635    -35.3395    -10.7983     -0.0229
         9       -19.1670    111.0510    -48.3645     14.5065      0.0308
        10         6.4911     -2.4245     -5.4014     -0.4450     -0.0009
        11        -1.0203      0.0344      7.4214      2.1451      0.0046
        12       -20.2302     12.1132     -1.6611     -3.2594     -0.0069
        13       -10.4574    -46.9306    -10.3401    -22.5760     -0.0479
        14       -23.3974     -6.2553      1.5165     -9.3788     -0.0199
        15       -38.9059     -4.5632      2.3604    -13.7029     -0.0291
        16        -6.0909     -1.0895     -0.0234     -2.4013     -0.0051
        17       -39.8961      8.0886    -37.2376    -23.0150     -0.0488
        18         4.0796      6.6531     -0.8046      3.3093      0.0070
        19        -1.8963     27.3476     11.2560     12.2357      0.0260
        20        -1.4446      9.1073     -3.3512      1.4372      0.0030
8楼2010-03-21 00:08:08
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