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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】模拟数据和优化结构不是一个空间群
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

[交流] 【求助】模拟数据和优化结构不是一个空间群

我用一个单晶结构，优化后得到的数据，出空间群不一样外，其他都基本吻合，请问这是怎么回事？

十分感谢
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
1楼 2010-02-21 09:41:12
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xirainbow

木虫 (正式写手)
★
qasd(金币+1):xiexie 2010-02-22 08:23
输出的结果的对称性比输入的要高些
很正常啊
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2楼2010-02-21 09:51:18
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
Originally posted by xirainbow at 2010-02-21 09:51:18:
输出的结果的对称性比输入的要高些
很正常啊

那我用单晶数据导入，然后降低对称性优化，是否可以得到和原来单晶一样的空间群以及其它数据呢？
谢谢你来回答哇，感谢！
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
3楼2010-02-21 12:55:19
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xirainbow

木虫 (正式写手)
★
qasd(金币+1):xiexie 2010-02-22 08:23
不一定
因为你导入的数据不一定是最稳定的
优化完有可能会找到另一个稳态
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4楼2010-02-21 14:10:08
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jiewei

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小才
引用回帖:
Originally posted by xirainbow at 2010-02-21 14:10:08:
不一定
因为你导入的数据不一定是最稳定的
优化完有可能会找到另一个稳态

我知道单晶也不一定是最稳定存在的，但是一般的文章还是以单晶数据位标准，如果发文章的话，也肯定是采用单晶的空间群，而不会采用我优化出来的空间群，所以这个问题如何解决呢？
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
5楼2010-02-21 16:00:05
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xirainbow

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by jiewei at 2010-02-21 16:00:05:

我知道单晶也不一定是最稳定存在的，但是一般的文章还是以单晶数据位标准，如果发文章的话，也肯定是采用单晶的空间群，而不会采用我优化出来的空间群，所以这个问题如何解决呢？

不明白你的意思
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6楼2010-02-21 17:56:48
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
Originally posted by xirainbow at 2010-02-21 17:56:48:

不明白你的意思

有机物长成单晶，然后解析单晶得到的结构，就是单晶结构嘛，这个结构不一定就是这个有机物最稳定的状态（因为单晶也是在一定条件下长成的）
现在我用在某个条件下长出的单晶，得到的解析结构直接输入MS中，然后对这个结构进行理论优化，最后得到的结构与输入的结构有区别，区别就是空间群不一样，而其他数据差不多（如，a，b，c；α β γ )
请问模拟得到的结构为什么与原来单晶结构得到的空间群会不一样呢？如果使得用单晶结构作为输入文件，然后优化得到的结构的空间群和单晶结构的空间群是一样的呢？
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
7楼2010-02-21 19:38:14
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xirainbow

木虫 (正式写手)
★ ★
qasd(金币+2):xiexie 2010-02-22 08:24
jiewei(金币+5): 2010-02-22 09:26
每一个空间群，都有自己所对应的对称操作
你可以比较一下两个结构
看看究竟是哪些原子的移动，最终导致了空间群的改变
如果你输入结构时，使用MS搜索得到了一个空间群，并在优化的时候保持了这个空间群；那么你就是要看一下，哪些原子的移动，最终导致出现了新的对称操作。
然后再反过来看你的实验数据（比如四元单晶），看看是不是可以将其归入实验误差。

注：我对从实验数据反对单晶结构几乎一无所知，所以上面说的很可能会被你笑的：）

[ Last edited by xirainbow on 2010-2-21 at 21:33 ]
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8楼2010-02-21 21:31:40
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
Originally posted by xirainbow at 2010-02-21 21:31:40:
每一个空间群，都有自己所对应的对称操作
你可以比较一下两个结构
看看究竟是哪些原子的移动，最终导致了空间群的改变
如果你输入结构时，使用MS搜索得到了一个空间群，并在优化的时候保持了这个空间群；那么你 ...

非常感谢你的说明，祝你新年快乐 O(∩_∩)O~
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
9楼2010-02-22 09:26:30
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