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huairpan

木虫 (正式写手)

很牛

[交流] 【求助/交流】软件求助:将蛋白质序列逆转录成核酸序列

求助一款软件,能够完成下述功能:已知蛋白氨基酸序列,得出其编码核酸。、
谢谢
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我思故我在
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)


amisking(金币+1): 2010-02-20 10:28
得出的编码核酸不是唯一的哦
2楼2010-02-20 10:00:47
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huairpan

木虫 (正式写手)

很牛

引用回帖:
Originally posted by lxj341401 at 2010-02-20 10:00:47:
得出的编码核酸不是唯一的哦

应该是不唯一的,有偏好性吧
我思故我在
3楼2010-02-20 10:13:15
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主


1949stone(金币+1):呵呵 楼主的都给你了么 2010-02-20 18:59
huairpan(金币+5):多谢 2010-02-21 10:55
剩下的金币都给我吧,这个很easy的,
用BLAST啊
选择tblastn这个工具就可以搞定了,没有比这个更权威的了
别告诉我你不知道BLAST,你可是金虫啊
4楼2010-02-20 16:29:56
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anny66cb

银虫 (小有名气)

楼上正解!!
5楼2010-02-20 16:46:52
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anny66cb

银虫 (小有名气)

楼上正解!!
6楼2010-02-20 16:50:10
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

金虫仅表示金币数量达到一定标准而已
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
7楼2010-02-20 20:20:56
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1949stone

荣誉版主 (知名作家)

海纳百川

海纳百川止于至善
8楼2010-02-20 20:23:15
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段家一凡

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by silicare at 2010-02-20 16:29:56:
剩下的金币都给我吧,这个很easy的,
用BLAST啊
选择tblastn这个工具就可以搞定了,没有比这个更权威的了
别告诉我你不知道BLAST,你可是金虫啊

不是很easy的,我想该金虫的目的是从氨基酸序列推出DNA序列,可能有软件,但一般是找某一蛋白的保守区域设计引物,然后去PCR扩增或作为探针去找另一个有较远的亲缘关系物种的同源基因,可能吧。如上所述,也可以BLASTP一下你的氨基酸序列,找到该氨基酸序列后,在当前网页就有编码该氨基酸序列的基因的accession NO号,点该号就可以得到基因序列了。但是不能直接用BlastN,因为你的是蛋白质序列。
9楼2010-02-20 22:20:07
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by 段家一凡 at 2010-02-20 22:20:07:

不是很easy的,我想该金虫的目的是从氨基酸序列推出DNA序列,可能有软件,但一般是找某一蛋白的保守区域设计引物,然后去PCR扩增或作为探针去找另一个有较远的亲缘关系物种的同源基因,可能吧。如上所述,也可以 ...

请仁兄看清我的回答再做辩驳
10楼2010-02-21 08:05:18
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