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gydgs033

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何从NCBI上查找已知序列号的基因全长

请教高手哈
1)已知一个基因序列号:4297
     如何从NCBI上查找全长,请告诉我详细步骤,非常感谢。
2)如果要阅读全长,是否还需要下载一个BIOEDIT的软件。
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yucheng9255

木虫 (著名写手)

你可以blast一下
2楼2010-02-08 10:37:04
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)

gydgs033(金币+1): 2010-02-09 19:53
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/这是NCBI的网站,然后在serch中输入你的基因序列号,即可以得到。下载到序列(就是复制和黏贴的过程),然后可以对这断序列进行编辑了。我一般用的DNAstar,我已经上传了附件。你解压后安装,然后从开始菜单的程序里直接找到DNAstar,在里面点击EditSeq,然后出现的页面的左上角选择file,子文件第一个是new里面有DNA和protein2个选择,就可以进去阅读和编辑了~~~如果有需要,我可以再给你提供一个BLAST工具~~
看的开才是真本事~
3楼2010-02-08 11:21:23
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)

不好意思,这个压缩有限制=。=只能分成2个部分发,你解压后连在一起即可。
看的开才是真本事~
4楼2010-02-08 11:22:31
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gydgs033

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cyjwx123 at 2010-02-08 11:21:23:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/这是NCBI的网站,然后在serch中输入你的基因序列号,即可以得到。下载到序列(就是复制和黏贴的过程),然后可以对这断序列进行编辑了。我一般用的DNAstar,我已经上传了 ...

能再详细一点么,我输入了序列号,会出来好几个类似DNA选项,不知道该选哪一个,你能把我说的那个序列号下来给我么,非常感谢。
5楼2010-02-09 19:53:45
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)

gydgs033(金币+1): 2010-03-15 20:47
因为你只在serch里输入了4297,所以你在大范围里搜索的话它会出现很多的链接,在每个链接的前面有1或者none,1则说明在这个链接里找到了你要的编号为4297的东西,none则没有。而你要找的是基因,所以,你的结果应该在gene这个里面找。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?term=4297这是4297这个gene的链接(最好你自己尝试下)
谢谢支持·~
看的开才是真本事~
6楼2010-02-09 20:00:47
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)

给你附上一张截图吧~~
看的开才是真本事~
7楼2010-02-09 20:09:00
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gydgs033

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cyjwx123 at 2010-02-09 20:00:47:
因为你只在serch里输入了4297,所以你在大范围里搜索的话它会出现很多的链接,在每个链接的前面有1或者none,1则说明在这个链接里找到了你要的编号为4297的东西,none则没有。而你要找的是基因,所以,你的结果应 ...

你说的这个链接我能找到,只是不知道那个序列在下面的哪个选项里,打开Genomic context和Genomic regions, transcripts, and products似乎还会出现好几个不同染色体带的选项,所以很晕,其它选项也试了几次,总不能确定,所以说你能告诉序列在哪个选项么,就是在这之后的路径,非常感谢
8楼2010-02-11 09:48:40
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zhanglijing0

银虫 (正式写手)

9楼2010-03-01 14:20:56
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