应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】NEB搜索过渡态不收敛？
171/2返回列表12下一页
查看: 1585  |  回复: 16
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

liyong.gan

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】NEB搜索过渡态不收敛？

用NEB搜索过渡态，任务能提交上去且正常计算，用不同的参数试了（IBRION），但是就是不收敛，不知道什么地方出错，向大家请教一下。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼2010-01-31 22:46:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lfhuang

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
liyong.gan(金币+1):谢谢参与
liyong.gan(金币+2):谢谢回复~ 2010-02-01 21:36
qasd(金币+3):xiexie 2010-02-01 23:03
（1）NEB方法需要一些参数，建议楼主参考原始的两三篇文章，而且里面作者也是有测试例子的。文章应该很容易找到，因为这个方法太有名了；
（2）原子质量改小一点，不计算声子，原子质量不影响任何结果。质量小，原子跑得快。建议都改到H原子重量量级，或更低。
赞一下(2人) 回复此楼
先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
2楼2010-02-01 08:13:39
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)
★
liyong.gan(金币+1):谢谢参与
liyong.gan(金币+2):明天贴数据上来，今天回家了~~~谢谢啊~~~~ 2010-02-01 21:37
怎么不收敛，你把你的输入文件先贴出来看看
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-02-01 18:55:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jing15209791

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
liyong.gan(金币+1):谢谢参与
qasd(金币+2):xiexie 2010-02-01 23:03
liyong.gan(金币+2):谢谢~~~~~~~~~~~请问要具体怎么引入开关函数呢? 2010-02-02 00:06
NEB得到的路径容易出现曲折，收敛也较慢，解决这一问题可以引入开关函数，即某点与两个相邻点之间形成的夹角越小，此点就引入更多的弹簧势垂直于路径的分量，使路径不易弯曲而变得光滑。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-02-01 21:38:52
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong.gan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-01 18:55:18:
怎么不收敛，你把你的输入文件先贴出来看看

压缩文件里面是我NEB计算的文件：“INCAR" ”KPOINTS“ ”CONTCAR-init“ ”CONTCAR-final“和结果文件“10838.chess_254.chess”。看结果文件没看到收敛的迹象，不知道问题出在什么地方，请教大家哈~~~谢谢了~~~~~~~~~~

[ Last edited by liyong.gan on 2010-2-2 at 14:52 ]
赞一下 回复此楼
5楼2010-02-02 14:44:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong.gan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by jing15209791 at 2010-02-01 21:38:52:
NEB得到的路径容易出现曲折，收敛也较慢，解决这一问题可以引入开关函数，即某点与两个相邻点之间形成的夹角越小，此点就引入更多的弹簧势垂直于路径的分量，使路径不易弯曲而变得光滑。

谢谢~~~~~~~~~~~请问要具体怎么引入开关函数呢?在INCAR里面怎么设置？
赞一下 回复此楼
6楼2010-02-02 14:45:39
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)
liyong.gan(金币+2):十分感谢 2010-02-02 19:57
你把OUTCAR 文件贴出来，还有，你用的是CI-NEB么？
赞一下 回复此楼
7楼2010-02-02 19:53:00
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong.gan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-02 19:53:00:
你把OUTCAR 文件贴出来，还有，你用的是CI-NEB么？

我做的是CO2分子，用的是NEB，不是CI-NEB。
下午把image数改成3（奇数），INCAR，初态和末态都没变，又计算了一遍还是不收敛，每一个image的OUTCAR在下面的压缩文件里面。谢谢~~~~~~~
http://www.namipan.com/d/OUTCAR0 ... b84c7570e1291790a00
http://www.namipan.com/d/OUTCAR0 ... 7fc8f6f50fa04dc0700

[ Last edited by liyong.gan on 2010-2-2 at 20:16 ]
赞一下 回复此楼
8楼2010-02-02 20:03:14
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)
★
liyong.gan(金币+2):谢谢 2010-02-07 22:02
aylayl08(金币+1):感谢交流 2010-02-08 09:20
引用回帖:
Originally posted by liyong.gan at 2010-02-02 20:03:14:

我做的是CO2分子，用的是NEB，不是CI-NEB。
下午把image数改成3（奇数），INCAR，初态和末态都没变，又计算了一遍还是不收敛，每一个image的OUTCAR在下面的压缩文件里面。谢谢~~~~~~~
[url]http://www.namipa ...

你的NEB是CI-NEB,还有你的OUTCAR有warning ，说你的原子距离太小。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2010-02-03 09:45:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong.gan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-03 09:45:09:

你的NEB是CI-NEB,还有你的OUTCAR有warning ，说你的原子距离太小。

那我在用nebmake.pl命令生成的image里，能手动改变其结构吗？比如通过命令线性插值的image里面某个结构C-O键很短，我能手动改变C或者O的坐标伸长它们的键长？因为太短的话，原子间的力就很大，不容易收敛。
赞一下 回复此楼
10楼2010-02-07 22:06:27
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liyong.gan 的主题更新
171/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭