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liyong.gan

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】NEB搜索过渡态不收敛?

用NEB搜索过渡态,任务能提交上去且正常计算,用不同的参数试了(IBRION),但是就是不收敛,不知道什么地方出错,向大家请教一下。
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lfhuang

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
liyong.gan(金币+1):谢谢参与
liyong.gan(金币+2):谢谢回复~ 2010-02-01 21:36
qasd(金币+3):xiexie 2010-02-01 23:03
(1)NEB方法需要一些参数,建议楼主参考原始的两三篇文章,而且里面作者也是有测试例子的。文章应该很容易找到,因为这个方法太有名了;
(2)原子质量改小一点,不计算声子,原子质量不影响任何结果。质量小,原子跑得快。建议都改到H原子重量量级,或更低。
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
2楼2010-02-01 08:13:39
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)


liyong.gan(金币+1):谢谢参与
liyong.gan(金币+2):明天贴数据上来,今天回家了~~~谢谢啊~~~~ 2010-02-01 21:37
怎么不收敛,你把你的输入文件先贴出来看看
3楼2010-02-01 18:55:18
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jing15209791

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
liyong.gan(金币+1):谢谢参与
qasd(金币+2):xiexie 2010-02-01 23:03
liyong.gan(金币+2):谢谢~~~~~~~~~~~请问要具体怎么引入开关函数呢? 2010-02-02 00:06
NEB得到的路径容易出现曲折,收敛也较慢,解决这一问题可以引入开关函数,即某点与两个相邻点之间形成的夹角越小,此点就引入更多的弹簧势垂直于路径的分量,使路径不易弯曲而变得光滑。
4楼2010-02-01 21:38:52
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liyong.gan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-01 18:55:18:
怎么不收敛,你把你的输入文件先贴出来看看

压缩文件里面是我NEB计算的文件:“INCAR" ”KPOINTS“ ”CONTCAR-init“ ”CONTCAR-final“和结果文件“10838.chess_254.chess”。看结果文件没看到收敛的迹象,不知道问题出在什么地方,请教大家哈~~~谢谢了~~~~~~~~~~

[ Last edited by liyong.gan on 2010-2-2 at 14:52 ]
5楼2010-02-02 14:44:08
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liyong.gan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by jing15209791 at 2010-02-01 21:38:52:
NEB得到的路径容易出现曲折,收敛也较慢,解决这一问题可以引入开关函数,即某点与两个相邻点之间形成的夹角越小,此点就引入更多的弹簧势垂直于路径的分量,使路径不易弯曲而变得光滑。

谢谢~~~~~~~~~~~请问要具体怎么引入开关函数呢?在INCAR里面怎么设置?
6楼2010-02-02 14:45:39
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)

liyong.gan(金币+2):十分感谢 2010-02-02 19:57
你把OUTCAR 文件贴出来,还有,你用的是CI-NEB么?
7楼2010-02-02 19:53:00
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liyong.gan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-02 19:53:00:
你把OUTCAR 文件贴出来,还有,你用的是CI-NEB么?

我做的是CO2分子,用的是NEB,不是CI-NEB。
下午把image数改成3(奇数),INCAR,初态和末态都没变,又计算了一遍还是不收敛,每一个image的OUTCAR在下面的压缩文件里面。谢谢~~~~~~~
http://www.namipan.com/d/OUTCAR0 ... b84c7570e1291790a00
http://www.namipan.com/d/OUTCAR0 ... 7fc8f6f50fa04dc0700

[ Last edited by liyong.gan on 2010-2-2 at 20:16 ]
8楼2010-02-02 20:03:14
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)


liyong.gan(金币+2):谢谢 2010-02-07 22:02
aylayl08(金币+1):感谢交流 2010-02-08 09:20
引用回帖:
Originally posted by liyong.gan at 2010-02-02 20:03:14:

我做的是CO2分子,用的是NEB,不是CI-NEB。
下午把image数改成3(奇数),INCAR,初态和末态都没变,又计算了一遍还是不收敛,每一个image的OUTCAR在下面的压缩文件里面。谢谢~~~~~~~
[url]http://www.namipa ...

你的NEB是CI-NEB,还有你的OUTCAR有warning ,说你的原子距离太小。
9楼2010-02-03 09:45:09
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liyong.gan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by ice_rain at 2010-02-03 09:45:09:

你的NEB是CI-NEB,还有你的OUTCAR有warning ,说你的原子距离太小。

那我在用nebmake.pl命令生成的image里,能手动改变其结构吗?比如通过命令线性插值的image里面某个结构C-O键很短,我能手动改变C或者O的坐标伸长它们的键长?因为太短的话,原子间的力就很大,不容易收敛。
10楼2010-02-07 22:06:27
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