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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】吸附建模加O问题！
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liang7035

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】吸附建模加O问题！

要做O的吸附，晶体结构建立以后，要在晶胞中的原子上方加入O原子的话，步骤是不是先找到要加的原子的坐标，x，y，z，如果氧原子x,y的坐标和那个原子的坐标相同，只是z坐标不同，要在这个原子上方加O原子的话，O原子的Z的坐标=原子Z坐标+原子半径+O原子半径   这样不知道对不对？请高手指点！
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
1楼 2010-01-29 10:31:43
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hgye

金虫 (小有名气)
★ ★
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aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-01-29 19:42
z坐标不需要这么仔细算吧，大概估计个距离能成键就行，然后做优化
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2楼2010-01-29 12:36:06
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qphll

金虫 (正式写手)
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aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-01-29 19:42
对, Z_O = Z + X, X = 1~3A
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Life, Love, Laugh.
3楼2010-01-29 12:36:44
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liang7035

金虫 (正式写手)
请问怎么个距离算是能成键啊，高手指点！
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
4楼2010-01-30 18:14:47
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study163

木虫 (正式写手)

天生我材
★
ice_rain(金币+1):xiexie~ 2010-02-02 11:36
引用回帖:
Originally posted by liang7035 at 2010-01-30 18:14:47:
请问怎么个距离算是能成键啊，高手指点！

两个原子成键不是看在图形界里两个原子能连上与否。你可以选 实验上的键长作 为初始键长输入。
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我的计算我做主
5楼2010-02-02 09:13:55
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qgqgrm

木虫 (小有名气)
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ice_rain(金币+1):xiexie~ 2010-02-03 09:34
氧原子初始距离不用太精确，设置一个大概的值就可，在结构优化过程中会自动调整。
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孜孜以求
6楼2010-02-02 15:22:16
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liuxianlv

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ice_rain(金币+1):谢谢交流 2010-02-03 20:21
看文献，文献里有两原子的键长为多少是是成键了，什么长度是物理吸附
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7楼2010-02-03 16:35:00
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guoguo3138

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2):谢谢指点 2010-02-18 09:39
氧的距离不用这么精细，但是如果有实验值作为参考可以用实验值，如果没有尽量精细但不要太苛求，进行优化就可以了，只是优化时间会稍长一些。
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8楼2010-02-12 14:27:09
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guoguo3138

银虫 (小有名气)
是否成键及成键的性质只需要看键能就可以了。
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9楼2010-02-12 14:29:27
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