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奔鲨

铁虫 (著名写手)

[交流] 【求助】肼类几何构型优化，r(N-N)>r(N-C)？

肼类分子，即N-N基团，两侧连4个基团。比如甲基。
这两天优化了一下结构，比如二甲基肼，(CH3)2-N-NH2,结果优化后，N-N键长为1.478anstroms, N-C为1.459anstroms,
N无论从电负性还是原子半径考虑，不应该比后者大啊！
有人做过电子衍射，给出值是，r(N-N) = 1.437, r (N-C) = 1.469

试过了B3LYP/6-31G(d), B3PW91/6-31G(d,p)，后者两个值均有所减小。也用了MP2，与B3LYP接近。
用了下半经验AM1，1.3975,1.4679
PM3是1.4672、1.4871
用实验数据做初始输入与默认输入是一样的结果
加opt=tight
scf=tight
一样的结果
这是为什么呢

[ Last edited by 奔鲨 on 2010-1-29 at 11:58 ]
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to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
1楼 2010-01-28 13:32:55
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1): 2010-01-29 12:41
键长没注意过
不过原来计算一个肼类，6-31g给出的键角和二面角偏差很大（无论怎么加极化与弥散），非得6-311g(d)或更高的价键劈裂基组不可
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3楼2010-01-29 10:26:42
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
而且，人家有人发文章说（中国人发在中国的非化学类杂志上），用DFT-B3LYP-6-31G(d)，得到与实验很接近的结果我重复咋就重复不来
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2楼2010-01-28 14:25:51
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by Jasminer at 2010-01-29 10:26:42:
键长没注意过
不过原来计算一个肼类，6-31g给出的键角和二面角偏差很大（无论怎么加极化与弥散），非得6-311g(d)或更高的价键劈裂基组不可

我也用了6-311G++(d,p)，结果与6-31G(d)差不多。
我还没注意键角那些，因为键长比键角、二面角对体系能量的影响要大得多。
到底是为什么呢
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4楼2010-01-29 12:01:53
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
今天忽然想起用chemoffice，先用chem3D生成出示结构，MM2优化，然后提交gaussian计算，优化，居然得到了好的结果。
看来以后不可以盲目用gview做初始结构了
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6楼2010-02-10 12:20:41
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