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maomao1210

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】编译器,数学库安装。已有1人参与

经常遇到编译器的安装,以及各种数学库的安装,还有一些常用软件的安装,最基本的能力。呵呵
如果能有个高手把这个总结一下的话,岂不是很好?让大家都来学习一下。
编译器:pgi, ifort,等等
数学库: blas, lapack, atlas, mkl 等等
常用软件就很多了,分子轨道理论方面的,密度泛函方面的,呵呵
希望能有高手给总结一下。让我们都来学习操作操作。
可惜我是一个linux盲,所以只能在这里呼吁了。呵呵。
为了此个项目,我决定拿出我全部的金币做为资助。
pgi 的安装过程,100 金币
ifort 的安装过程,100金币
mpich 的安装过程,100金币
blas+lapack的安装过程,160金币
atlas的安装过程,100金币
mkl的安装过程,100金币
共660金币。
呵呵。总结后,大家都可以来学习一下。
金币就这么多了,所以常用软件的安装就没有金币贡献了,呵呵,等赚了钱再继续来求贤,呵呵。

[ Last edited by maomao1210 on 2010-1-28 at 10:45 ]
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zyz1981

至尊木虫 (文坛精英)

医学物理

LAPACK + ATLAS安装指南

1. make.inc
基本上,在linux上面,如果你gcc是装好的,make.inc参数我修改的就是把库文件的_LINUX后缀给取消了。

BLASLIB      = ../../blas.a  #这个下面有解释
LAPACKLIB    = lapack.a
TMGLIB       = tmglib.a
EIGSRCLIB    = eigsrc.a
LINSRCLIB    = linsrc.a

如果你想对lapack的编译进行优化,你可以指定CPU,比如我的cpu(Core 2 Duo E6750),在OPT后面加上 -march=nocona 。

2.使用自带blas库:

如果你要用LAPCK自带的refblas.a 库(就是不更改../../blas.a 这一行),你需要更改根目录下的 Makefile,把

lib: lapacklib tmglib
#lib: blaslib lapacklib tmglib

改为

#lib: lapacklib tmglib
lib: blaslib lapacklib tmglib

就可以了(就是说,先编译refblas库,生成blas.a文件,然后再编译其他程序)。

3. 使用优化的BLAS库,比如ATLAS

如果你有优化的BLAS库,比如机器优化的atlas,可以用比如 -lf77blas -latlas 来替换第一个 ../../blas.a ,同时,保持2)步里面的 lib: 行为原始状态(不包含 blaslib)

BLASLIB      = -L/usr/lib/atlas -lf77blas -latlas

当然,这个只是测试用途。你甚至可以不管它。

4.
下面就是 make ,我一般用普通用户在emacs下面编译,有什么错误一眼能看见,最后sudo make install 来安装。

转自:http://www.ccthere.com/article/1524741
34楼2010-01-29 15:06:46
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亲核取代

铁杆木虫 (知名作家)

-无关讨论,删除-

[ Last edited by nono2009 on 2010-1-29 at 10:11 ]
2楼2010-01-28 11:48:04
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maomao1210

金虫 (正式写手)

感谢nono2009,余泽成领导的支持。呵呵。非常感谢。
3楼2010-01-28 13:41:45
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mao_yijian

铁杆木虫 (著名写手)

-无关讨论,删除-

[ Last edited by nono2009 on 2010-1-29 at 10:12 ]
坚持“四项基本原则”
4楼2010-01-28 13:46:58
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