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maomao1210

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】编译器,数学库安装。 已有1人参与

经常遇到编译器的安装,以及各种数学库的安装,还有一些常用软件的安装,最基本的能力。呵呵
如果能有个高手把这个总结一下的话,岂不是很好?让大家都来学习一下。
编译器:pgi, ifort,等等
数学库: blas, lapack, atlas, mkl 等等
常用软件就很多了,分子轨道理论方面的,密度泛函方面的,呵呵
希望能有高手给总结一下。让我们都来学习操作操作。
可惜我是一个linux盲,所以只能在这里呼吁了。呵呵。
为了此个项目,我决定拿出我全部的金币做为资助。
pgi 的安装过程,100 金币
ifort 的安装过程,100金币
mpich 的安装过程,100金币
blas+lapack的安装过程,160金币
atlas的安装过程,100金币
mkl的安装过程,100金币
共660金币。
呵呵。总结后,大家都可以来学习一下。
金币就这么多了,所以常用软件的安装就没有金币贡献了,呵呵,等赚了钱再继续来求贤,呵呵。

[ Last edited by maomao1210 on 2010-1-28 at 10:45 ]
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zyz1981

至尊木虫 (文坛精英)

医学物理

CLAPACK的安装与简单使用

CLAPACK是LAPACK的C语言接口。LAPACK的全称是Linear Algebra PACKage,是非常著名的线性代数库。LAPACK是用Fortran写的,为了方便C/C++程序的使用,就有了LAPACK的C接口库CLAPACK。LAPACK的主页是http://www.netlib.org/lapack/,CLAPACK则在http://www.netlib.org/clapack/

安装CLAPACK首先自从其主页上下载CLAPACK包http://www.netlib.org/clapack/clapack.tgz,解压。在其目录下的INSTALL目录中有make.inc的范本文件,比如在linux下就是make.inc.LINUX,将这个文件拷到CLAPACK目录下并改名为make.inc,并修改此文件中的相应参数,如果需要的话。CLAPACK需要F2CLIBS的libI77.a和libF77.a,一个tmglib和blas,这几个库都包含在了CLAPACK的安装包中,但是blas可以选用其他优化过的版本以得到更好的性能。在此我们使用CLAPACK中的blas。

首先编译F2CLIBS,用于将fortran转换为c语言,在CLAPACK目录下,make f2clib,在
CLAPACK/F2CLIBS下就会生成libI77.a和libF77.a。
编译tmglib,在CLAPACK目录下,make tmglib,会生成CLAPACK/tmglib_LINUX.a。
编译blas,在CLAPACK目录下,make blaslib,会生成CLAPACK/blas_LINUX.a。
最后是编译CLAPACK,make,会生成CLAPACK/lapack_LINUX.a

CLAPACK下的clapack.h就是所需要的头文件,除此之外还需要的一个头文件是F2CLIBS/f2c.h。

现在就通过使用CLAPACK中的一个函数sgesv_解线性方程组来学习一下使用的方法。

包括此函数在内的所有函数可以在CLAPACK/SRC下找到源代码,并在代码中有函数参数的说明信息。sgesv_的代码文件就是sgesv.c。

int sgesv_(integer *n, integer *nrhs, real *a, integer *lda, integer *ipiv, real *b, integer *ldb, integer *info)

sgesv_的功能是使用LU分解法解线性方程组AX=B,其中A是一个n*n的方阵。

integer *n, 方程的个数,也就是A的行数和列数
integer *nrhs, B的列数
real *a, 存储矩阵A数据的一维数组,在fortran中,数组是列主序存储,在此a中的二维数据也必须是列主序
integer *lda, 等于n
integer *ipiv, 一个输出数据数组,数组大小是n,具体什么功能不太明白,但是似乎不影响最后结果,谁明白请告诉我
real *b,存储矩阵B数据的一维数组,在fortran中,数组是列主序存储,在此b中的二维数据也必须是列主序
integer *ldb, 等于n
integer *info,输出参数,如果返回此参数为0,表示函数正常退出,否则表示出错

在此,我用了高教同济大学版线性代数第二版106页,2题(1)的数据。

A:
4,2,-1
3,-1,2
11,0,3

B:
2
10
8

代码:
#include
usingnamespace std;
#include
//因为程序是C++,而CLAPACK是C语言写的,所以在此处用extern关键字
extern"C"
{

    #include
}
int main(void) {
   
    integer M=3 ;
    integer N=1;
   
    real a[9]={4,3,11,2,-1,0,-1,2,3};
    real b[3]={2,10,8};

    integer lda;
    integer ldb;

    integer INFO;

    lda=M;
    ldb=M;
   
    integer ipiv[M];
   
    sgesv_(&M, &N, a, &lda,ipiv, b, &ldb, &INFO);
   
    if(INFO==0)
    {
       for(int i=0;i        {      
           cout<<        }      
    }
    else
    {
       cout<<"Failed."<     }   
   
    return EXIT_SUCCESS;
}

程序编译链接的时候,lapack_LINUX.a,tmglib_LINUX.a,blas_LINUX.a,libF77.a,libI77.a 这几个库文件都需要链接进去。

运算结果:
-14
56
54


转自:http://blog.csdn.net/daiyuchao/archive/2008/01/04/2026162.aspx
31楼2010-01-29 14:55:24
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亲核取代

铁杆木虫 (知名作家)

-无关讨论,删除-

[ Last edited by nono2009 on 2010-1-29 at 10:11 ]
2楼2010-01-28 11:48:04
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maomao1210

金虫 (正式写手)

感谢nono2009,余泽成领导的支持。呵呵。非常感谢。
3楼2010-01-28 13:41:45
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mao_yijian

铁杆木虫 (著名写手)

-无关讨论,删除-

[ Last edited by nono2009 on 2010-1-29 at 10:12 ]
坚持“四项基本原则”
4楼2010-01-28 13:46:58
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