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maomao1210

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】编译器,数学库安装。 已有1人参与

经常遇到编译器的安装,以及各种数学库的安装,还有一些常用软件的安装,最基本的能力。呵呵
如果能有个高手把这个总结一下的话,岂不是很好?让大家都来学习一下。
编译器:pgi, ifort,等等
数学库: blas, lapack, atlas, mkl 等等
常用软件就很多了,分子轨道理论方面的,密度泛函方面的,呵呵
希望能有高手给总结一下。让我们都来学习操作操作。
可惜我是一个linux盲,所以只能在这里呼吁了。呵呵。
为了此个项目,我决定拿出我全部的金币做为资助。
pgi 的安装过程,100 金币
ifort 的安装过程,100金币
mpich 的安装过程,100金币
blas+lapack的安装过程,160金币
atlas的安装过程,100金币
mkl的安装过程,100金币
共660金币。
呵呵。总结后,大家都可以来学习一下。
金币就这么多了,所以常用软件的安装就没有金币贡献了,呵呵,等赚了钱再继续来求贤,呵呵。

[ Last edited by maomao1210 on 2010-1-28 at 10:45 ]
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zyz1981

至尊木虫 (文坛精英)

医学物理

在Linux环境下Lapack软件包的编译和使用

  1. 从 netlab 下载最新版本的源代码
 
  http://www.netlib.org/lapack/lapack-3.1.0.tgz
 
  2. 将源代码解压缩
 
  tar -zxf lapack-3.1.0.tgz
 
  3. 编辑 make.inc 文件,进行一些系统相关的编译参数设置
 
  PLAT : 设置生成的库函数的后缀,比如 SUN, LINUX之类的,当然也可以不设置;
 
  FORTRAN : 设置编译器,比如 g77, gfortran, ifort, g95 等等;
 
  OPT:设置编译选项,根据具体的编译器和优化要求进行设置;
 
  LOADER : 设置成和FORTRAN 一样就可以了;
 
  4. 编辑 Makefile
 
  找到 lib: 选项。然后设置需要编译的库函数如下
 
  #lib: lapacklib tmglib
 
  lib: blaslib lapacklib tmglib
 
  默认的情况是不编译 blas 库的。
 
  5. 编译和测试 Lapack.
 
  在源代码的根目录下输入 make 回车。然后 make 程序就会自动进行编译和测试。
 
  6. Lapack 函数的使用
 
  如果编译和测试顺利的话会在源代码的根目录下生成三个文件 lapack.a、blas.a、tmglib.a.lapack.a 和 blas.a 就是我们所需要的库函数。它们的使用有两种途径:
 
  a) cp lapack.a liblapack.a , cp blas.a libblas.a 并拷贝到 LD_LIBRARY_PATH 目录下,或者它们所在的目录加入到 LD_LIBRARY_PATH 环境变量中,或者在编译时候加上 “-L lapack所在目录/” 选项。编译的时候加上编译选项 -llapack -lblas.
 
  b) 编译的时候直接把 lapack.a 和 blas.a 一起同需要编译的代码一起编译。比如 要编译的文件为 main.f90 编译器为 gfortran . gfortran main.f90 lapack.a blas.a.
 
  当然也可以将 Lapack 做成动态链接库文件的形式来使用。当然,在 linux 系统下也可以直接安装编译好的文件比如 redhat 、suse 安装 rpm 格式的文件,在 ubuntu 和 debian 系统下,安装 deb 格式的文件。但是最好还是根据自己的环境自己编译库函数,这样速度会快一些。我曾在 ubuntu 下做过实验一般情况下速度关系为,自己编译的库函数 > 编译好的库函数 > 调用 matlab 函数。
 

转自:http://linux.chinaitlab.com/soft/736727.html
30楼2010-01-29 14:53:13
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亲核取代

铁杆木虫 (知名作家)

-无关讨论,删除-

[ Last edited by nono2009 on 2010-1-29 at 10:11 ]
2楼2010-01-28 11:48:04
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maomao1210

金虫 (正式写手)

感谢nono2009,余泽成领导的支持。呵呵。非常感谢。
3楼2010-01-28 13:41:45
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mao_yijian

铁杆木虫 (著名写手)

-无关讨论,删除-

[ Last edited by nono2009 on 2010-1-29 at 10:12 ]
坚持“四项基本原则”
4楼2010-01-28 13:46:58
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