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maomao1210

金虫 (正式写手)

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[交流] 【讨论】编译器，数学库安装。已有1人参与

经常遇到编译器的安装，以及各种数学库的安装，还有一些常用软件的安装，最基本的能力。呵呵
如果能有个高手把这个总结一下的话，岂不是很好？让大家都来学习一下。
编译器：pgi, ifort,等等
数学库： blas, lapack, atlas, mkl 等等
常用软件就很多了，分子轨道理论方面的，密度泛函方面的，呵呵
希望能有高手给总结一下。让我们都来学习操作操作。
可惜我是一个linux盲，所以只能在这里呼吁了。呵呵。
为了此个项目，我决定拿出我全部的金币做为资助。
pgi 的安装过程，100 金币
ifort 的安装过程，100金币
mpich 的安装过程，100金币
blas+lapack的安装过程，160金币
atlas的安装过程，100金币
mkl的安装过程，100金币
共660金币。
呵呵。总结后，大家都可以来学习一下。
金币就这么多了，所以常用软件的安装就没有金币贡献了，呵呵，等赚了钱再继续来求贤，呵呵。

[ Last edited by maomao1210 on 2010-1-28 at 10:45 ]

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1楼 2010-01-28 10:43:18

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zyz1981

至尊木虫 (文坛精英)

医学物理

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专业: 肿瘤物理治疗

Linux下Lapack如何安装

安装lapack

1) gzip –cd lapack-3.1.1.tgz | tar xf -

2) cd lapack-3.1.1

3) cp make.inc.example make.inc

4) gedit make.inc



. . . . . . . . .
FORTRAN  = g77
OPTS    = -funroll-all-loops -O3
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT =
LOADER = g77
LOADOPTS =
. . . . . . . . .

修改成：



. . . . . . . . .
FORTRAN  = gfortran
OPTS    = -funroll-all-loops -O3
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT =
LOADER = gfortran
LOADOPTS =
. . . . . . . . .

保存



5) gedit Makefile

如果之前没安装blas:

include make.inc

all: lapack_install lib lapack_testing blas_testing

lib: lapacklib tmglib
#lib: blaslib lapacklib tmglib

clean: cleanlib cleantesting cleanblas_testing
. . . .

修改成：



include make.inc

all: lapack_install lib lapack_testing blas_testing

#lib: lapacklib tmglib
lib: blaslib lapacklib tmglib

clean: cleanlib cleantesting cleanblas_testing
. . . .



保存

6) make

7) 复制blas_LINUX.a lapack_LINUX.a和tmglib_LINUX.a则三个文件到/usr/lib和/usr/local/lib两个文件夹中，并改名为：libblas.a liblapack.a和libtmglib.a

-------------------------

用glibc的命令ldd就能知道程序是否动态连接的。

产生blas动态库要改动两处，一处是make.inc中给编译器加fPIC命令行参数，另一处是在makefile中修改制造库的命令，制造动态库是使用gcc，而制造静态库是ar命令。

-------------------------

我给楼上再补充一句，改成：
OPTS    = -funroll-all-loops -O3 -msse2 -mfpmath=sse -ftree-vectorize -g

加上-msse2 -mfpmath=sse -ftree-vectorize让gfortran编译成矢量sse代码而不是x87，速度甚至能提高50%；加上-g便于调试。

如果不是gfortran而是ifort，使用xP选项可达到同样的目的。

转自：http://blog.163.com/wanghui_jl@1 ... 734720082241046315/