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maomao1210金虫 (正式写手)
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[交流]
【讨论】编译器，数学库安装。 已有1人参与
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经常遇到编译器的安装，以及各种数学库的安装，还有一些常用软件的安装，最基本的能力。呵呵 如果能有个高手把这个总结一下的话，岂不是很好？让大家都来学习一下。 编译器：pgi, ifort,等等 数学库： blas, lapack, atlas, mkl 等等 常用软件就很多了，分子轨道理论方面的，密度泛函方面的，呵呵 希望能有高手给总结一下。让我们都来学习操作操作。 可惜我是一个linux盲，所以只能在这里呼吁了。呵呵。 为了此个项目，我决定拿出我全部的金币做为资助。 pgi 的安装过程，100 金币 ifort 的安装过程，100金币 mpich 的安装过程，100金币 blas+lapack的安装过程，160金币 atlas的安装过程，100金币 mkl的安装过程，100金币 共660金币。 呵呵。总结后，大家都可以来学习一下。 金币就这么多了，所以常用软件的安装就没有金币贡献了，呵呵，等赚了钱再继续来求贤，呵呵。 [ Last edited by maomao1210 on 2010-1-28 at 10:45 ] |
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zyz1981
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在Windows上编译并安装ATLAS BLAS
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如何在Windows上编译并安装ATLAS BLAS(上) 最近由于一些实验要用到线性代数库，因此便要找一个性能优良的，同时有公信力的线性代数库。 很早就知道了ATLAS的大名，在跨平台的高性能线性代数数学包中，可能要属ATLAS最有名了。因此从一开始便决定了要用ATLAS BLAS作为CPU的线性代数部分的性能和数学基准。 只是我在shell下面的经验太少，所以编译的时候被狠狠郁闷了一把。 因此这篇文章将以我的血泪史为一些E文和我一样烂的人铺好前进的道路。 ATLAS的版本里面，我推荐ATLAS 3.6.0的版本。不仅仅是因为这个版本是Stable的，更重要的是，3.7的版本安装方式有了不小的变化，一切都需要命令行直接设置，不像360可以依靠它所带的向导可以一步步的完成设置工作。因此安装起来颇为头大。所以以下的例子将以360为准。并且，如果需要支持多核或者多CPU，建议使用ScaLAPACK。 下载好ATLAS 360以后，第一反应自然是看Install.txt。 Install.txt里面说，如果你是在Windows系统下工作的话，需要参考另外一个帮助文档。实际上另外一个帮助文档只告诉你两件事情： 第一是如果你使用cygwin的话，那么一切都as normal，就是和Linux/Unix平台一样； 第二是如果你使用其它的编译器，如msvc或者icc(intel c++ compiler)的话，请参见XXX云云。 尽管理论上说支持MSVC和ICC，但是我觉得想用MSVC的同学还是先忍一忍，因为所有的编译参数都已经不是默认的了，需要重新设置，比方说INCLUDE和LIB，又比方说编译器选项。我又是个比较笨的人，所以就选择了as normal的cygwin。理论上说mingw也可以，但是mingw的sh不太好用，因此我也就没有在mingw上面顺利通过。同时如果你的机器上已经有mingw，记得安装完cygwin以后，把path这个环境变量里面mingw的路径替换成cygwin的路径。 先下载CYGWIN。gcc, g77, gnu make, mingw-gcc, mingw-g77, mingw-runtime这几项是必须要的。建议大家先选择Download without installing，把需要下载的东西准备好，然后在选择第三项从本地install。服务器很多人都推荐kernel.org。实际用来效果也不错。 cygwin下载，安装都OK了以后，先要补丁两个文件： “Assembler renaming problem for Windows machine“ 和 “String overrun in config for long compiler paths”。 我之所以失败了无数次就是因为把这个给漏掉了。 补丁打好以后，先测试一下make，gcc，g77能不能正常工作。 如果无误以后，就可以动手了。 先启动cygwin，bash进入atlas的安装目录（就是install.txt所在的目录） 然后就是直接运行 make 这一步是全部向导，按照向导的说明完成配置就好了，正常来说，这一步不会出现任何错误。 然后便是运行 make install arch= 这里的arch在上一步make完成的时候已经给了个样例，抄下来就可以了。 然后就是漫长又漫长的编译过程。。。 编译好以后，可以在$atlas/lib/ 如何在Windows上编译并安装ATLAS BLAS(下) 我们在cygwin环境中已经编译完成了.a文件。现在我们要把.a文件转换成动态链接库才能被大部分的Windows下的环境调用。 这一步可以分为两个部分， 第一部分是将.a使用gcc转换成win下面的动态链接库； 第二部分是为了隐式链接，可以使用lib工具再从dll里面生成lib。 本来这是个比较麻烦的事情，不过好在网上已经有现成的脚本了。（点击下载） 有两个地方需要修改， 第一个是libg2c.a需要指向到对应的文件夹。如果大家的cygwin附带的gcc344/g77 344的话，那么只需要找到libg2c的位置就可以了。 我的安装位置是 CLIBPATH=/usr/lib/mingw mingwclib="/lib/gcc/i686-pc-mingw32/3.4.4/libg2c.a $CLIBPATH/libmoldname.a $CLIBPATH/libmsvcrt.a" 如果是默认安装的话，这个设置应该是正确的。 第二个需要修改的地方在使用lib.exe生成链接库的时候。大家可以把环境设置的批处理文件路径设置正确就可以了。 转自： http://www.cppblog.com/lingjingqiu/archive/2007/05/21/24559.html http://www.cppblog.com/lingjingqiu/archive/2007/05/22/24597.html |
28楼2010-01-29 14:44:36
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