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maomao1210

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[交流] 【讨论】编译器，数学库安装。已有1人参与

经常遇到编译器的安装，以及各种数学库的安装，还有一些常用软件的安装，最基本的能力。呵呵
如果能有个高手把这个总结一下的话，岂不是很好？让大家都来学习一下。
编译器：pgi, ifort,等等
数学库： blas, lapack, atlas, mkl 等等
常用软件就很多了，分子轨道理论方面的，密度泛函方面的，呵呵
希望能有高手给总结一下。让我们都来学习操作操作。
可惜我是一个linux盲，所以只能在这里呼吁了。呵呵。
为了此个项目，我决定拿出我全部的金币做为资助。
pgi 的安装过程，100 金币
ifort 的安装过程，100金币
mpich 的安装过程，100金币
blas+lapack的安装过程，160金币
atlas的安装过程，100金币
mkl的安装过程，100金币
共660金币。
呵呵。总结后，大家都可以来学习一下。
金币就这么多了，所以常用软件的安装就没有金币贡献了，呵呵，等赚了钱再继续来求贤，呵呵。

[ Last edited by maomao1210 on 2010-1-28 at 10:45 ]

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1楼 2010-01-28 10:43:18

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zyz1981

至尊木虫 (文坛精英)

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MPICH的安裝和設定

1. ???dmpich

??ftp.mcs.anl.gov??pub/mpi?????????d

ex :

wget ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpi/mpich.tar.gz

2. ???s

ex :

tar zxvf mpich.tar.gz

????

gzip -dc mpich.tar.gz | tar xvf -

3. ?M?B?O??

???M????s???????????./configure???M?B?O?????O???????A?O?

./configure

?????help file?????????????

./configure --help

?????????PGI????fortran compiler?????ε??O??????

./configure -fc=pgf77 -f90=pgf90 --prefix=/tmp/mpich

-fc??????????????fortran compiler??-f90???O??????fortran90 compiler????????@?e????PGI??server?棬??????b?O????PGI??--prefix???compile??????????????????

??PGI??????????h????????O??env CFLAGS="-fast" CXXFLAGS="-fast" FFLAGS="-fast" F90FLAGS="-fast" LDFLAGS="-fast" \OPTFLAGS="-fast" CC="pgcc" CXX="pgCC" F90="pgf90" FC="pgf77" CPP="pgCC -E" \./configure --prefix=/path/to/install/dir???fortran compiler??pgf77??pgf90???Bc & c++ compiler???pgcc

?????vasp????mpich???M?B?O??????

./configure -prefix=/usr/local/mpich_nodvdbg -fc="pgf77 -Mx,119,0x200000" \

-f90="pgf90 -Mx,119,0x200000" \

--without-romio --without-mpe -opt=-O

4. ???g???b

???M?B?O?????????????make??M??compile

ex :

make

?Bcompile???]???e?`?l???????????????make install???b

ex :

make install

5. ?O??????????a??File System??remote shell

???P?O??????????NServer??????????a??????????(???h???NIS????NIS+)??File Systemy??????C?g??mount(???d)????????(??????NFS??autofs???)????????????node??????????thread?@?N??????SMP???C??????O????????Server??????remote shell?????O??(????M?B?O???r?]???????úηNremote shell??mpich?A?O?????rsh)

6. ?O??share/machine.LINUX

?????b???mpich????????shrea/machine.LINUX

ex :

cd /usr/local/mpich

???????mpich???b??/usr/local/mpich

cd share

vi machine.LINUX

hpk1:2

k31

k32

??machine.LINUX?n??????????mpich?????C???Q???????C?ж???thread???????????????????thread????

7. ?O??MPICH??h?????

export MPI_HOME=/usr/local/mpich

export MPI_ARCH=$MPI_HOME/bin/tarch

export PATH=$MPI_HOME/bin:$PATH

export MANPATH=$MPI_HOME/man:$MANPATH

8. ?y?MPICH

cd /usr/local/mpich

cd example

make

mpirun -np 4 pi3f90

Note :

????????ε??????C????O????MPICH??h?????????MPICH???????A?O??compiler?r??B??compiler??h?????????O??

????http://wsunccake.spaces.live.com ... B93B43420!116.entry