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【求助/交流】关于编码区和开放阅读框
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一篇博士论文上看到如下：某基因编码区自起始密码子（ATG）至终止密码子（TAA）长1518bp，5‘非编码区（UTR）为70bp，3’非编码区（UTR）为65bp，包含4个外显子和3个内含子，开放阅读框大小为1239bp，编码412个氨基酸残基。 我想请问的是：编码区不就是一个完整的开放阅读框么？论文上面写的我有些不解，哪位高人帮指点指点，不胜感激！ |
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snoopyzxx
木虫 (著名写手)
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CDS是Coding sequence的缩写，是编码一段蛋白产物的序列，是结构基因组学术语。 与开放读码框ORF的区别 （1）开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列；不是所有读码框都能被表达出蛋白产物，或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。 （2） CDS，是编码一段蛋白产物的序列。 （3） cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。 （4）反之，每个orf不一定都是cds。 （5）Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide. Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA ORF-----translation, CDS----transcription translation 是理论上的，而transcription则显然是事实存在的。 |
3楼2010-01-27 11:17:46
2楼2010-01-27 10:31:10
qqsvery
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论坛上面已经有很多相关的问题，建议你看看： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1541295 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1540223 |
4楼2010-01-27 11:58:21
