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taotao1825

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何在ncbi上找一个基因的启动子序列

如何在NCBI上找一个基因的启动子序列
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1楼 2010-01-26 16:50:04
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taotao1825

银虫 (小有名气)
自己顶一下
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2楼2010-01-26 19:10:23
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen
可以上网下载一个NCBI教程，一般都可以找到的~
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Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
3楼2010-01-26 20:10:54
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yang0071

木虫 (职业作家)
★
taotao1825(金币+1):如果我要把一个基因的启动子序列pcr扩出来,难道要扩2000bp的大片段?这个一是不好扩,二是不好连载体做转化啊,什么是荧光报告基因系统?这个要花钱买系统把?有没有更便宜省事的呢? 1-27 08:56
先在基因组序列中找到你要的序列，
一般上游2000bp包含了promoter序列。
使用荧光报告基因系统来确认promoter的位置。
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4楼2010-01-26 21:58:33
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xuezhen

银虫 (小有名气)
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5楼2010-01-27 00:02:32
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yang0071

木虫 (职业作家)
2000bp不算大片段
很容易连进载体的
自己google  PGL3B vector
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6楼2010-01-27 11:28:13
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cff-1009

金虫 (初入文坛)
很关注！希望大家能提供好建议！！
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7楼2010-01-29 18:35:16
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)
taotao1825(金币+4):谢谢 2010-03-01 08:27
这个还是很好解决的。首先你先要找到这个基因，然后查看它的DNA全序列，并同时找到它的mRNA的序列。在mRNA中你可以定位到exon1的位置，这个exon1包含了一个5‘的UTR和部分的CDS序列，再与你找的DNA序列进行对比，看exon1在DNA序列的位置，找到位置之后你就能在上游的区域中找到启动子的序列，找的方法就是根据一般的基因结构和启动子的序列特征了~
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看的开才是真本事~
8楼2010-02-09 14:03:01
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yucheng9255

木虫 (著名写手)
启动子序列还是有一定特征的
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9楼2010-02-09 15:23:51
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