应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】已知一段基因的保守序列，如何获得两端，而得到全长序列？请达人指教。�
81/1返回列表
查看: 1088  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

波澜不惊

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】已知一段基因的保守序列，如何获得两端，而得到全长序列？请达人指教。�

那保守序列不是cDNA，不知道能不能用RACE的方法做？这个植物的全基因组的测序已经完成，能不能通过分析上下游一定长度的序列，确定启动子和终止子，来克隆这个基因呢？
我刚做，可能问题有点小白。见谅！呵呵
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-01-26 09:56:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+1): 1-26 10:58
首先明确你是要完整的cDNA序列，还是完整的ORF序列，
已知序列先blast就知道是基因组还是cDNA序列了，
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2010-01-26 10:49:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是这样的，你首先得到的是保守序列，那就和相关物种的该基因比对一下（cADN），确定这段序列是否包含于cDNA，或者获得包含于cDNA的一部分，就可以做RACE了，用包含于cDNA的保守序列设计3‘RACE和5’RACE引物，扩增片段是否重叠都不要紧，最后将三段拼接成cDNA全长，用ORF分析，即可获得开放阅读框

完成全基因组测序可以分析出启动子和终止子，但是无法剔除内含子，可以用核酸序列和蛋白质序列同时比对，分析剔除内含子，但是不保证完全正确，需要一些生物信息学知识，我也知道的不多
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-01-26 12:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gastrodia

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
保守序列？你可以根据此保守序列设计引物以cDNA为模板进行扩增，将所得条带送去测序进行验证，如果是，根据扩出来的cDNA设计5‘和3'RACE的引物，或者分析上下游一定长度的序列，确定启动子和终止子，来克隆这个基因
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-01-26 14:36:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

grxx_wj

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
以上大家 说得很好  但是楼主  我要说的是 如果你只做网上比对 拼接 是达不到目的的，因为电子拼接 是允许错误的 也就是 你能拼上 但不准确 只有实验 扩增全长 才可以算上一个结果 但是可以与网上做个比较  也就是说 你只是为了毕业 就电子拼接 想做点东西 就做实验  如果你是博士 老板有钱 建议还是送到公司 做 扩全长 （RACE）一条也就1000左右  省时间 我师弟就拿去公司做的 很方便
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-01-27 09:39:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

波澜不惊

铁虫 (初入文坛)
十分感谢各位的解答！
那我现在就是可以从两个方面着手。
一个是，分析下现在已有的序列中哪些包含于cDNA中，然后就可以设计引物通过3‘  5’RACE 来获得我要克隆的基因的cDNA.
另一个是，分析上下游序列，确定启动子和终止子，来克隆这个基因全长。包含内含子。
对吗？？
再请教一下4楼，如果送到公司做，我都需要提供什么？能拿到什么结果？
再次感谢!
赞一下 回复此楼
6楼2010-01-27 11:59:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我是懒人

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我是小白，难道保守序列还有很多种么？
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-01-28 02:31:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jAnmee

银虫 (正式写手)
各位达人真厉害…
赞一下 回复此楼
国荣，家驹，MJ，为什么我喜欢的恩都死了。。。。
8楼2010-01-28 03:44:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 波澜不惊 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:32 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:26 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:24 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:02 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 00:53 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 22:47 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 21:02 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:45 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 5/250 2026-11-10 19:45 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭