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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】求S16rRNA法鉴定菌株的详细步骤
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love14xu

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求S16rRNA法鉴定菌株的详细步骤

求S16rRNA法鉴定菌株的详细步骤，请各位高手帮帮忙
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1楼 2010-01-21 22:21:53
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
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司马诸葛(金币+2):谢谢 1-25 14:19
细菌具有5S, 16S, 23S三种rRNA，其中5S rRNA序列较短，包含的细菌遗传信息量少，不适合用于分析鉴定细菌种类，而23S rRNA序列较长，且碱基突变速率要比16S rRNA快得多，不适用对较远亲缘关系的细菌进行鉴定。16S rRNA其大小约1500 bp ，所代表的细菌遗传信息量适中，是进行细菌分类研究的理想材料。
细菌16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA的DNA序列，存在于所有细菌染色体基因中，它由保守区序列及可变区序列两部分组成。细菌16S rDNA的可变区序列能够显示细菌间不同分类等级水平上的特异性，适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究，并可作为测量细菌进化和亲缘关系的良好工具，同时可以利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
只要您提供细菌菌株或基因组总DNA，我处即可完成细菌分子鉴定的全部工作。
★服务价格
1)        细菌16S rDNA部分序列分析：300元/样品
2)        细菌16S rDNA全序列分析：500元/样品
★服务周期：
    30样品以下在收到样品后五个工作日内提交结果。
    30样品以上依据具体细菌样品数量而定。
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2楼2010-01-22 09:50:29
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qiuxiaofan88

禁虫 (小有名气)
★ ★
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司马诸葛(金币+1):谢谢 1-25 14:19
本帖内容被屏蔽
3楼2010-01-22 09:57:32
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priorpost06

至尊木虫 (著名写手)
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司马诸葛(金币+1): 1-25 14:19
第一步：提取细菌总DNA，电泳检测是否提取出来。
第二步：设计引物，PCR，检测电泳结果，查阅你的目的条带在多少bp。
第三步：对PCR产物进行测序。
第四步：上NCBI网进行比对。
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4楼2010-01-22 20:51:54
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85715623

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+1): 1-25 14:19
1.提取基因组DNA
2.设计引物，PCR扩增，回收
3.连接，转化
4.验证（PCR、酶切）
5.测序
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5楼2010-01-22 21:44:45
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zrb7858

至尊木虫 (著名写手)

片风
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+1): 1-25 14:20
第一步：提取细菌总DNA，电泳检测是否提取出来。
第二步：寻找通用引物（一般是27F和1492R），PCR，检测电泳结果，查阅你的目的条带在多少bp。
第三步：对PCR产物进行测序。
第四步：上NCBI网进行比对
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6楼2010-01-23 09:37:14
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qdwmq

木虫 (正式写手)
★
司马诸葛(金币+1):谢谢参与 1-25 14:20
1.提取基因组DNA
2.设计引物，PCR扩增，回收
3.连接，转化
4.筛菌
5.序列测定
6.比对
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7楼2010-01-24 20:51:17
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
16s是不用设计引物的，都是用通用引物来PCR的，5楼的说法是对的
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8楼2010-01-25 09:38:28
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