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love14xu

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求S16rRNA法鉴定菌株的详细步骤

求S16rRNA法鉴定菌株的详细步骤,请各位高手帮帮忙
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
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司马诸葛(金币+2):谢谢 1-25 14:19
细菌具有5S, 16S, 23S三种rRNA,其中5S rRNA序列较短,包含的细菌遗传信息量少,不适合用于分析鉴定细菌种类,而23S rRNA序列较长,且碱基突变速率要比16S rRNA快得多,不适用对较远亲缘关系的细菌进行鉴定。16S rRNA其大小约1500 bp ,所代表的细菌遗传信息量适中,是进行细菌分类研究的理想材料。
细菌16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中,它由保守区序列及可变区序列两部分组成。细菌16S rDNA的可变区序列能够显示细菌间不同分类等级水平上的特异性,适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究,并可作为测量细菌进化和亲缘关系的良好工具,同时可以利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
只要您提供细菌菌株或基因组总DNA,我处即可完成细菌分子鉴定的全部工作。
★服务价格
1)        细菌16S rDNA部分序列分析:300元/样品
2)        细菌16S rDNA全序列分析:500元/样品
★服务周期:
    30样品以下在收到样品后五个工作日内提交结果。
    30样品以上依据具体细菌样品数量而定。
2楼2010-01-22 09:50:29
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qiuxiaofan88

禁虫 (小有名气)

★ ★
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本帖内容被屏蔽

3楼2010-01-22 09:57:32
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priorpost06

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
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司马诸葛(金币+1): 1-25 14:19
第一步:提取细菌总DNA,电泳检测是否提取出来。
第二步:设计引物,PCR,检测电泳结果,查阅你的目的条带在多少bp。
第三步:对PCR产物进行测序。
第四步:上NCBI网进行比对。
4楼2010-01-22 20:51:54
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85715623

木虫 (正式写手)

★ ★
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司马诸葛(金币+1): 1-25 14:19
1.提取基因组DNA
2.设计引物,PCR扩增,回收
3.连接,转化
4.验证(PCR、酶切)
5.测序
5楼2010-01-22 21:44:45
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zrb7858

至尊木虫 (著名写手)

片风

★ ★
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司马诸葛(金币+1): 1-25 14:20
第一步:提取细菌总DNA,电泳检测是否提取出来。
第二步:寻找通用引物(一般是27F和1492R),PCR,检测电泳结果,查阅你的目的条带在多少bp。
第三步:对PCR产物进行测序。
第四步:上NCBI网进行比对
6楼2010-01-23 09:37:14
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qdwmq

木虫 (正式写手)


司马诸葛(金币+1):谢谢参与 1-25 14:20
1.提取基因组DNA
2.设计引物,PCR扩增,回收
3.连接,转化
4.筛菌
5.序列测定
6.比对
7楼2010-01-24 20:51:17
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


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16s是不用设计引物的,都是用通用引物来PCR的,5楼的说法是对的
8楼2010-01-25 09:38:28
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