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acridine

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于pwscf计算产生的一些文件

以前用castep和dmol比较多,现在开始改行用pwscf,对于基本的参数设置都大同小异,没有遇到太大的麻烦。不过最近想整理一下硬盘空间时遇到了点问题。计算结果中有很多的文件不知道是做什么的,所以不确定是否应该继续保留,希望有业内人事帮忙。

首先是xxx.save文件夹中的一些文件:
charge-density.dat,spin-polarization.dat这两个文件比较大,应该是存储计算结果的电子密度的信息吧,我知道这个对于再次计算应该很重要,结果文件中可以看到The initial density is read from file:charge-density.dat
另外还有多个Kxxxxx的文件夹,里面是eigenval.xml 应该是记录各个k点本征值。这些文件都比较小。
另外还有个atomic_proj.xml特别大,应该是计算PDOS时产生的,不过不知道这个文件具体有什么用

而与.save文件夹并列的还有xxx.wfc以及xxx.mix文件,是特别大的文件。由于这个文件在并行的时候会分成 .wfc1、 .wfc2、 ……这样的多个文件,所以我最初认为它们只是计算时产生的临时文件,但发现删除它们之后就无法直接计算pdos了,需要先进行nscf计算,再次产生wfc文件之后才可以继续计算pdos。看来也是存储电子结构信息的,但它和charge-density.dat有什么不同呢?
是否是这样的:charge-density.dat只是总的电荷密度信息,而wfc文件才是具体波函数的信息?

如果我的观点没错,那么我是否可以这样:对于我处理的体系wfc文件要比charge-density.dat大很多个量级,那么在我进行了相关性质的计算之后,仅仅保存charge-density.dat文件以节省硬盘空间,即使将来真的需要重新计算这个体系其他性质,,我也可以简单的从charge-density出发进行nscf计算就可以得到波函数?
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xirainbow

木虫 (正式写手)


ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 1-20 13:33
acridine(金币+5):多谢,很有帮助 2010-02-11 17:41
你最后一段话,理论上是可行的
但是,软件具体如何执行的,你必须查看源文件才能确定(或者试试就可以确定)

wfc是波函数
晶体pdos是波函数向原子波函数的投影
你如果删除了wfc,就没有了晶体波函数,就无法投影了
2楼2010-01-20 12:31:15
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goldenfisher

金虫 (著名写手)


qasd(金币+1):xiexie 2010-02-10 09:56
acridine(金币+5):多谢,很有帮助 2010-02-11 17:41
其实我个人认为一个工作完成后,临时文件都可以删除掉。做一次scf计算相对来说不是什么麻烦事,以后再用可以再算。并行的时候,产生的文件相对大一些。
3楼2010-02-09 19:13:25
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acridine

木虫 (正式写手)

多谢二位的帮助了,呵呵,主要是俺的计算体系比较大,又是一系列的计算,而且远程计算中心给分配的机时和存储空间有限,一时间有些捉襟见肘,见笑了
现在问题基本解决了,分配的存储空间增加了,多谢两位关注了
4楼2010-02-11 17:47:54
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enola

捐助贵宾 (正式写手)

学习啦

学习到啦
timeflies..
5楼2010-02-18 08:43:20
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